299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3619 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  100 
 
 		 251 aa  503  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  59.22 
 
 		 207 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  57.77 
 
 		 207 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  57.77 
 
 		 207 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  56.31 
 
 		 207 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  55.83 
 
 		 207 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  50.48 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  54.37 
 
 		 207 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  50.48 
 
 		 295 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  50.21 
 
 		 327 aa  238  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  50.48 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  50.48 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  52.5 
 
 		 297 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  50.48 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  50.48 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  50.48 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  51.5 
 
 		 297 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  51.5 
 
 		 297 aa  234  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  52.17 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  55.92 
 
 		 212 aa  228  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  49.76 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  51.44 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  50.72 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  50.72 
 
 		 285 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  50.72 
 
 		 285 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  50.72 
 
 		 285 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  50.72 
 
 		 285 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  52.56 
 
 		 285 aa  219  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  49.54 
 
 		 284 aa  219  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  55.77 
 
 		 291 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  52.4 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  52.4 
 
 		 290 aa  215  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  50.48 
 
 		 291 aa  215  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  49.29 
 
 		 296 aa  215  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  47.83 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  47.83 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  47.83 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  47.83 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  47.83 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  47.83 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  47.83 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  47.83 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  50.95 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  50.24 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  50.24 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  46.86 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  50 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  49.5 
 
 		 299 aa  204  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  49.75 
 
 		 293 aa  202  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  47.83 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  49.54 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.29 
 
 		 319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  51.79 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  49.3 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  50.53 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  43.83 
 
 		 278 aa  184  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  46.46 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  50.25 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  47.62 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  46.12 
 
 		 218 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  46.38 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  41.97 
 
 		 264 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  28.75 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  27.85 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  23.53 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  27.8 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 		 193 aa  62  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  25.69 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  26.77 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  29.58 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  31.39 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  29.9 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  25.28 
 
 		 174 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  30.15 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  26.89 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  24.55 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01880  nicotinamidase-like amidase  33.33 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.29 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  34.31 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>