More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1016 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1016  amidase  100 
 
 		 200 aa  415  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  45.6 
 
 		 198 aa  151  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  43.37 
 
 		 192 aa  148  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  41.97 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  42.63 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  41.75 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  36.87 
 
 		 199 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  36.87 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  41.58 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  39.69 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  39.69 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  39.69 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  39.69 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  39.69 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  40.39 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  41.92 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  40.91 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  41.8 
 
 		 193 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  37.82 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  37.63 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  37.63 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  35.68 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  35.68 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  35.68 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  35.68 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  35.68 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  35.68 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  35.18 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  37.11 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  37.76 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  35.83 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  35.11 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 		 185 aa  99  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 185 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  27 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  26.84 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  28.05 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  23.18 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  25.93 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  26.5 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  24.56 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  28.28 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  24.87 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  23.81 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  24.88 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  38.67 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  38.67 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  27.49 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  38.67 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  38.67 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  24.52 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  27.32 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  38.67 
 
 		 102 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  36.14 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  37.33 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  26.28 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  38.67 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  26.42 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  24.37 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  27.51 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1463  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  36 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  26.96 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 342 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  23.04 
 
 		 359 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>