260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3647 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3647  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1996  isochorismatase hydrolase  52.06 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2011  isochorismatase hydrolase  45.99 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4334  isochorismatase hydrolase  44.86 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366283  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1787  isochorismatase hydrolase  45.65 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1834  isochorismatase hydrolase  45.65 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1768  isochorismatase hydrolase  44.57 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8742  isochorismatase hydrolase  41.15 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4162  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  32.83 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4119  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  26.82 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  30.25 
 
 		 533 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  25.23 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  24.37 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 329 aa  61.2  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  24 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.56 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  25.63 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  27.6 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  24.88 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  25 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  25.47 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  22.87 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  27.91 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  25.43 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  25.81 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  31.03 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  27.49 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  31.14 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  31.14 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  31.14 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  26.94 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  26.5 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  28.99 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  26.47 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  25.88 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  25.85 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  27.33 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  27.33 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  27.33 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  32.5 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  31.85 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  34.95 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  23.5 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  34.95 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  35.05 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  38.04 
 
 		 182 aa  51.6  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  34.95 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  30.05 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  39.24 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  25.91 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  31.71 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.71 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  29.81 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  29.19 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  30.83 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>