36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1105 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1105  isochorismatase  100 
 
 		 84 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 188 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  100 
 
 		 188 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  98.63 
 
 		 188 aa  147  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  80.56 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  80.56 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  80.56 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  80.56 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  80.56 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  72.22 
 
 		 188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  68.49 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  61.43 
 
 		 199 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  62.86 
 
 		 199 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  46.05 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  52.73 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  49.09 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  49.09 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  44.29 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  49.09 
 
 		 190 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  43.94 
 
 		 195 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  43.94 
 
 		 200 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  46.03 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  49.15 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  41.1 
 
 		 199 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  42.42 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  45.45 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  47.95 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  47.46 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  51.72 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  39.44 
 
 		 244 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>