150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0273 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0273  amidase  100 
 
 
170 aa  353  3.9999999999999996e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2040  isochorismatase hydrolase  48.81 
 
 
174 aa  168  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0388  conserved hypothetical protein, putative amidase  40.34 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0207  conserved hypothetical protein, putative amidase  39.18 
 
 
170 aa  124  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0114  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  38.15 
 
 
173 aa  120  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0154  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  38.15 
 
 
173 aa  120  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0745833  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0126  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  38.15 
 
 
173 aa  120  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.357919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  28.49 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  29.35 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  25.87 
 
 
209 aa  61.2  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 
180 aa  60.8  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 
186 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 
186 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  28.49 
 
 
182 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 
190 aa  57.8  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  28.49 
 
 
182 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  32.94 
 
 
193 aa  57.8  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  25.88 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  24.88 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  27.93 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 
193 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  25.62 
 
 
209 aa  55.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  27.93 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  34.23 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  27.93 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.89 
 
 
206 aa  55.1  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  27.93 
 
 
182 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  26.84 
 
 
195 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  27.37 
 
 
182 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 
192 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  25.12 
 
 
209 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  25.25 
 
 
208 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  26.19 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  31.97 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  25.98 
 
 
203 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  27.13 
 
 
201 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  26.67 
 
 
201 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
214 aa  52  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
184 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 
182 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  26.29 
 
 
206 aa  51.6  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  26.75 
 
 
192 aa  51.6  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  31.41 
 
 
181 aa  51.6  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 
201 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
201 aa  51.6  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 
201 aa  51.2  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  29.66 
 
 
189 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  27.86 
 
 
212 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  28.37 
 
 
209 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.41 
 
 
166 aa  50.8  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  29.44 
 
 
192 aa  50.8  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl340  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.81 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.148128  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  25.53 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  26.84 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  28.22 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  26.02 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  26.11 
 
 
208 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 
224 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  26.6 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  24.4 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  26.87 
 
 
205 aa  48.9  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
193 aa  48.5  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 
201 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  26.6 
 
 
199 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
201 aa  48.5  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  23.88 
 
 
206 aa  48.9  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  25.41 
 
 
206 aa  48.5  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  25.43 
 
 
174 aa  48.5  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  24.39 
 
 
190 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  27.62 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  24.38 
 
 
225 aa  47.8  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  29.38 
 
 
211 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0349  nicotinamidase  26.42 
 
 
248 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1010  nicotinamidase  26.75 
 
 
204 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.4989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  24.75 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  25.88 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  30 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.1 
 
 
215 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  24.68 
 
 
195 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  25.58 
 
 
198 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  24.38 
 
 
237 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  27.68 
 
 
207 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  28.39 
 
 
206 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  25.74 
 
 
201 aa  45.1  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
192 aa  45.1  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.77 
 
 
203 aa  44.7  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  33.33 
 
 
102 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 
183 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>