58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1792 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  100 
 
 
175 aa  361  3e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  35.71 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  35.16 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1765  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 
223 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1178  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 
241 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000195875  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0227  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 
226 aa  98.6  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.448166  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  35.12 
 
 
248 aa  97.4  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0395  hypothetical protein  29.67 
 
 
218 aa  96.3  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4288  nicotinamidase-like amidase  35.03 
 
 
233 aa  92.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0144  nicotinamidase-like amidase  30.43 
 
 
238 aa  88.6  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 
176 aa  88.2  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0502  cytoplasmic membrane protein  28.41 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0388  nicotinamidase-like amidase  30.19 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1062  cytoplasmic membrane protein  32.72 
 
 
242 aa  82  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
237 aa  81.3  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  23.83 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  29.65 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 
193 aa  60.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  33.95 
 
 
203 aa  57.8  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  29.38 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  30.06 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  29.44 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  31.16 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  28.81 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0273  amidase  31.97 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  28.81 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 
174 aa  51.2  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 
178 aa  51.2  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 
204 aa  51.2  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 
188 aa  50.8  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  34.85 
 
 
180 aa  50.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  28.25 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  28.25 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.01 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 
213 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  28.33 
 
 
182 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  31.16 
 
 
201 aa  48.1  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 
201 aa  48.1  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  31.16 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  28.32 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 
201 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
201 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  34.35 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3726  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
247 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 
192 aa  42  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3779  isochorismatase hydrolase  27.16 
 
 
247 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>