58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1178 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1178  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 241 aa  494  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000195875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1765  isochorismatase hydrolase  62.61 
 
 		 223 aa  311  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  44.93 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  43.48 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  42.79 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0388  nicotinamidase-like amidase  34.33 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0144  nicotinamidase-like amidase  35.51 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  39.64 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4288  nicotinamidase-like amidase  33.5 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0502  cytoplasmic membrane protein  36.04 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0227  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.448166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1062  cytoplasmic membrane protein  30.64 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0395  hypothetical protein  32.85 
 
 		 218 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  36.96 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  27.73 
 
 		 221 aa  98.2  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 174 aa  62  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  26.57 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  28.47 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3726  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.08 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3779  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  28.36 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2452  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.55 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  24.69 
 
 		 174 aa  50.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  25.79 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  25.74 
 
 		 176 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  28.49 
 
 		 181 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  24.4 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  23.43 
 
 		 174 aa  46.2  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  25.85 
 
 		 193 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  23.08 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  25.44 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  26.62 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  28.75 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2040  isochorismatase hydrolase  30.88 
 
 		 174 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 		 180 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  24.05 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  26.11 
 
 		 209 aa  42.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  21.13 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  25.83 
 
 		 193 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  24.65 
 
 		 194 aa  42  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  24.66 
 
 		 192 aa  41.6  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>