62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0227 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0227  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.448166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0144  nicotinamidase-like amidase  42.13 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0388  nicotinamidase-like amidase  41.28 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  41.82 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4288  nicotinamidase-like amidase  45.54 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0395  hypothetical protein  36.99 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0502  cytoplasmic membrane protein  33.77 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  34.17 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1062  cytoplasmic membrane protein  33.48 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1765  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1178  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000195875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  32.81 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  29.73 
 
 		 175 aa  98.6  8e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  24.26 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  25.31 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  25.45 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  26.19 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  25.45 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3726  isochorismatase hydrolase  24.89 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3779  isochorismatase hydrolase  24.67 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  25.49 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.97 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1540  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00288771  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  29.17 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  23.64 
 
 		 174 aa  48.9  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  25.68 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.15 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  26.35 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  27.95 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  24.65 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  22.29 
 
 		 181 aa  45.1  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 		 190 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  24.71 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  22.83 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  22.83 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  22.83 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  25.45 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  26.04 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  25.27 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  22.03 
 
 		 182 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  25.43 
 
 		 201 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  27.21 
 
 		 180 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  26.01 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  25.43 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  26 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  26.88 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  23.33 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>