51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1062 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1062  cytoplasmic membrane protein  100 
 
 
242 aa  503  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0388  nicotinamidase-like amidase  45.81 
 
 
238 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  42.98 
 
 
237 aa  201  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0144  nicotinamidase-like amidase  43.59 
 
 
238 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4288  nicotinamidase-like amidase  42.24 
 
 
233 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  40.09 
 
 
248 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0502  cytoplasmic membrane protein  37.77 
 
 
226 aa  152  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0395  hypothetical protein  35.14 
 
 
218 aa  137  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0227  isochorismatase hydrolase  33.48 
 
 
226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.448166  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1178  isochorismatase hydrolase  30.64 
 
 
241 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000195875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1765  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 
223 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  30.88 
 
 
206 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  30.28 
 
 
206 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  32.72 
 
 
175 aa  82  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  26.01 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  27.95 
 
 
188 aa  60.1  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3726  isochorismatase hydrolase  25.99 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3779  isochorismatase hydrolase  25.99 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2452  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 
201 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 
201 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 
201 aa  56.2  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 
185 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  27.82 
 
 
178 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  26.95 
 
 
174 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 
176 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  26.53 
 
 
185 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  28.47 
 
 
192 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  27.46 
 
 
186 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  27.27 
 
 
198 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  27.21 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 
190 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.66 
 
 
180 aa  43.9  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 
180 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  26.85 
 
 
193 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  25.85 
 
 
192 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  23.94 
 
 
182 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 
184 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  23.24 
 
 
182 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 
184 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 
184 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>