33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0502 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0502  cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 226 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0395  hypothetical protein  57.8 
 
 		 218 aa  278  3e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0144  nicotinamidase-like amidase  41.53 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0388  nicotinamidase-like amidase  39.83 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  41.26 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4288  nicotinamidase-like amidase  41.2 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1062  cytoplasmic membrane protein  37.77 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  38.68 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0227  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.448166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1178  isochorismatase hydrolase  36.04 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000195875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1765  isochorismatase hydrolase  38.83 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  32.57 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  31.65 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  28.41 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 176 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  26.43 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  27.08 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.78 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  24.6 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 		 185 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  30.15 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  26.81 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3779  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3726  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  23.73 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 183 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 193 aa  42  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.34 
 
 		 180 aa  41.6  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>