74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0144 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0144  nicotinamidase-like amidase  100 
 
 		 238 aa  487  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0388  nicotinamidase-like amidase  89.08 
 
 		 238 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  63.83 
 
 		 237 aa  314  7e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4288  nicotinamidase-like amidase  52.38 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  43.39 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0502  cytoplasmic membrane protein  41.53 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1062  cytoplasmic membrane protein  43.59 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0395  hypothetical protein  39.53 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0227  isochorismatase hydrolase  42.13 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.448166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1178  isochorismatase hydrolase  35.51 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000195875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1765  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  32.26 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  31.8 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  30.43 
 
 		 175 aa  88.6  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  29.19 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.58 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  27.51 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  28.02 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 174 aa  52  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  27.71 
 
 		 181 aa  52  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  29.66 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.83 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  26.28 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2452  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 196 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  28.99 
 
 		 184 aa  49.3  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 186 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 201 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  26.39 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  28.06 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3779  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 174 aa  45.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  40.74 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 189 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  25.77 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  27.83 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3726  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  23.56 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  27.83 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  37.63 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1540  isochorismatase hydrolase  27.71 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00288771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  27.11 
 
 		 190 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  25.16 
 
 		 193 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  26.9 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  26.9 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  27.81 
 
 		 203 aa  42.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  25.6 
 
 		 182 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  20.45 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 190 aa  42  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  27.35 
 
 		 182 aa  42  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  25.15 
 
 		 182 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  26.51 
 
 		 182 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>