26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0395 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0395  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  449  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0502  cytoplasmic membrane protein  57.8 
 
 
226 aa  278  3e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0144  nicotinamidase-like amidase  39.53 
 
 
238 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0388  nicotinamidase-like amidase  39.53 
 
 
238 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  40.38 
 
 
237 aa  178  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4288  nicotinamidase-like amidase  40.38 
 
 
233 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0227  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 
226 aa  149  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.448166  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  37.44 
 
 
248 aa  141  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1062  cytoplasmic membrane protein  35.14 
 
 
242 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1765  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1178  isochorismatase hydrolase  32.85 
 
 
241 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000195875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  35.68 
 
 
206 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  35.05 
 
 
206 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  29.67 
 
 
175 aa  96.3  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  25.18 
 
 
185 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2452  isochorismatase hydrolase  29.37 
 
 
247 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  24.87 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 
196 aa  48.5  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3779  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3726  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  26.62 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.9 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  23.37 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  22.75 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  25 
 
 
181 aa  42.4  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>