64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0388 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0388  nicotinamidase-like amidase  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0144  nicotinamidase-like amidase  89.08 
 
 		 238 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  64.26 
 
 		 237 aa  322  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4288  nicotinamidase-like amidase  51.52 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  43.93 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1062  cytoplasmic membrane protein  45.81 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0502  cytoplasmic membrane protein  39.83 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0395  hypothetical protein  39.53 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0227  isochorismatase hydrolase  41.28 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.448166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1178  isochorismatase hydrolase  34.33 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000195875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1765  isochorismatase hydrolase  32.17 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  31.34 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  30.88 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  30.19 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  28.04 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  28.88 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  24.24 
 
 		 176 aa  52  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  28.24 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  26.06 
 
 		 181 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  24.49 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  24.63 
 
 		 176 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  26.37 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  28.37 
 
 		 184 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  28.37 
 
 		 184 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  28.37 
 
 		 184 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  24.82 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  26.62 
 
 		 174 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  26.62 
 
 		 174 aa  46.2  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  27.08 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 191 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  23.61 
 
 		 190 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1540  isochorismatase hydrolase  24.16 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00288771  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  25.13 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  25.93 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  27.22 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  27.11 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  26.38 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3779  isochorismatase hydrolase  26.6 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  28.45 
 
 		 186 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  28.45 
 
 		 186 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 201 aa  42.7  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3726  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2452  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  23.81 
 
 		 182 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  28.08 
 
 		 190 aa  41.6  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>