89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2452 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2452  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3726  isochorismatase hydrolase  71.26 
 
 		 247 aa  364  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3779  isochorismatase hydrolase  71.26 
 
 		 247 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1765  isochorismatase hydrolase  34 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1178  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000195875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1062  cytoplasmic membrane protein  28.76 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0144  nicotinamidase-like amidase  29.41 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  26.27 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  27.52 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0395  hypothetical protein  30.07 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  27.51 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0388  nicotinamidase-like amidase  28.38 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  28.31 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  27.12 
 
 		 184 aa  53.1  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 193 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.33 
 
 		 190 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  28.65 
 
 		 175 aa  51.6  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  25.82 
 
 		 182 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  29.38 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  27.66 
 
 		 186 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  25.27 
 
 		 182 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  23.32 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 186 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  25.29 
 
 		 182 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  25.29 
 
 		 182 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  25.29 
 
 		 182 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  29.76 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0227  isochorismatase hydrolase  22.08 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.448166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 189 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  25.88 
 
 		 182 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4288  nicotinamidase-like amidase  26.27 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 		 184 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  26.56 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  30 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  25.54 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  25.54 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  25.54 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  25.93 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  26.56 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  25.54 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 176 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  26.99 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  26.49 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  35.16 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  22.97 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  26.57 
 
 		 166 aa  45.4  0.0007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.78 
 
 		 213 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 195 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1540  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00288771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  32.21 
 
 		 192 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  25.22 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  25.83 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  25.22 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0502  cytoplasmic membrane protein  27.89 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  24.87 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  32.05 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  23.84 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  25.11 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  27.54 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 		 183 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  25.11 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  26.47 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  26.47 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 176 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  25.88 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 194 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  26.09 
 
 		 218 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  26.47 
 
 		 215 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  25.9 
 
 		 208 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  26.14 
 
 		 200 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  26.56 
 
 		 201 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>