56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1765 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1765  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 223 aa  461  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1178  isochorismatase hydrolase  62.61 
 
 		 241 aa  311  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000195875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  42.86 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  42.36 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  39.67 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  36.97 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4288  nicotinamidase-like amidase  36 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0144  nicotinamidase-like amidase  32.61 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0388  nicotinamidase-like amidase  32.17 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0502  cytoplasmic membrane protein  38.83 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0227  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.448166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0395  hypothetical protein  37.02 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  34.97 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1062  cytoplasmic membrane protein  32.57 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  27.51 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3726  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3779  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  26.18 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  31.2 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  25.62 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2452  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  29.34 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.2 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  24.32 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  27.14 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  26.95 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  26.62 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  26.35 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  24.71 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  25.17 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  32.03 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  25.75 
 
 		 174 aa  51.6  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.74 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  24.56 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  24.83 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  26.99 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  22.84 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  25.97 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  28.46 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  22.46 
 
 		 187 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  27.54 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  26.24 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  23.27 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 		 192 aa  42  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  23.57 
 
 		 215 aa  42  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  24.32 
 
 		 184 aa  42  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  25 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  22.29 
 
 		 240 aa  41.6  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>