49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0154 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0126  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  100 
 
 
173 aa  353  5.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.357919  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0154  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  100 
 
 
173 aa  353  5.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0745833  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0114  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  98.27 
 
 
173 aa  349  1e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0207  conserved hypothetical protein, putative amidase  58.96 
 
 
170 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0388  conserved hypothetical protein, putative amidase  35.43 
 
 
181 aa  127  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0273  amidase  38.15 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2040  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
174 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  27.54 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 
174 aa  58.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  25.4 
 
 
191 aa  55.1  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  24.74 
 
 
195 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  24.35 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  23.56 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.68 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  23.78 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  22.4 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  24.19 
 
 
193 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  23.12 
 
 
184 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  27.69 
 
 
214 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  23.12 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  26.6 
 
 
183 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  23.12 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  25.9 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  24.42 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  27.21 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  21.99 
 
 
206 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  23.12 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  26.04 
 
 
184 aa  45.1  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  25.9 
 
 
187 aa  44.3  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  22.67 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  22.46 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  22.33 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  23.03 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  22.87 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  23.17 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  23.03 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  23.03 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  21.95 
 
 
208 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 
180 aa  42  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  21.82 
 
 
182 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  21.58 
 
 
186 aa  42  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  28.15 
 
 
201 aa  41.6  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  24.39 
 
 
244 aa  41.2  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  24.81 
 
 
201 aa  41.2  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  22.55 
 
 
209 aa  40.8  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>