171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0678 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0678  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  100 
 
 		 170 aa  346  1e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0274495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  40.24 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  40.4 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  40.74 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 		 192 aa  97.4  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  37.82 
 
 		 201 aa  87.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  35.93 
 
 		 199 aa  84.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  33.33 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  33.33 
 
 		 213 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  32.98 
 
 		 208 aa  80.9  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  33.92 
 
 		 213 aa  80.9  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 210 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  36.55 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  35.12 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  35.1 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  34.3 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.62 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  34.39 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.05 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.05 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.05 
 
 		 213 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.05 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  30.05 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  32.62 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  32.62 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.6 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.06 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  30.05 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.05 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.51 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.24 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  35.58 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.51 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  31.84 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  30.05 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.67 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  29.5 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.77 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  32.16 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  31.11 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  32.56 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.51 
 
 		 218 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.51 
 
 		 218 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.51 
 
 		 218 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  32.2 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.51 
 
 		 218 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.51 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.51 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  32.95 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.96 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  31.79 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  30.23 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1692  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105025  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  32.16 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  32.76 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  31.79 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  33.33 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  29.71 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  36.57 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  29.67 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33075  NAD(+) salvage pathway gene  25.13 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  31.55 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.46 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  32.76 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  28.96 
 
 		 208 aa  63.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  32.95 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  32.02 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  34.86 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.57 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  28.49 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  30.68 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  26.37 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  29.44 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  30.85 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.49 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  29.34 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  30.06 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  32.39 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  32.39 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  32.39 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  28.25 
 
 		 197 aa  62  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  32.39 
 
 		 210 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.82 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.82 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  33.72 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>