More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5107 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5107  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0633461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2915  isochorismatase hydrolase  69.16 
 
 		 227 aa  322  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 		 237 aa  92  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  30.97 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  29.87 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  30.35 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  33.54 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  32.1 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  33.55 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  30.97 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  28.04 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  27.32 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  28.57 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  29.78 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  28.65 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  24.86 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  26.78 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  26.25 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  28.23 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  26.67 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8142  predicted protein  35.64 
 
 		 96 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  26.67 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  28.76 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  23.78 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  25.42 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  23.78 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  29.29 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  23.17 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  23.17 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  23.17 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  27.67 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  25.88 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  23.59 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  31.91 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  28.67 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  31.35 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  27.55 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  24.73 
 
 		 313 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  31.91 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  25 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  34.4 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  32.84 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  29.47 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  37 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  31.51 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  33.55 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  30.13 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  37 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  29.47 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  24.63 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  25.62 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>