270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0076 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 		 307 aa  634    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  66.91 
 
 		 302 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.43 
 
 		 306 aa  342  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  32.72 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  34.07 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  32.87 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  32.63 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.44 
 
 		 581 aa  149  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  32.4 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  32.37 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  33.8 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  33.09 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  33.1 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  31.74 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  33.67 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  31.25 
 
 		 533 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.72 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  30.58 
 
 		 350 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  32.86 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  32.06 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  30.77 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  30.9 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  33.33 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  30.31 
 
 		 324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  31.82 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  34.03 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  31.82 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  31.25 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  32.01 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.67 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  32.07 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  30.58 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  28.03 
 
 		 363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  28.03 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  31.06 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  29.35 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  29.41 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  31.14 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  29.14 
 
 		 338 aa  129  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  29.01 
 
 		 357 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  30.21 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  32.06 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  32.4 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  30.56 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  30.56 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  30.56 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  30.56 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  30.56 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  31.51 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  28.83 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  30.26 
 
 		 334 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.25 
 
 		 579 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  28.81 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  28.83 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  28.62 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.83 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  27.95 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.91 
 
 		 407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  28.9 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  30.85 
 
 		 545 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.06 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  29.18 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  27.76 
 
 		 351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  28.81 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  27.27 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  30.43 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  27.84 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  29.64 
 
 		 286 aa  109  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  28 
 
 		 281 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  26.99 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.1 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.85 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  30.56 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  24.83 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.63 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  28.24 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.07 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.84 
 
 		 406 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  29.93 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  25.7 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.28 
 
 		 298 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.28 
 
 		 298 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.93 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.93 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.93 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  28.37 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.56 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.84 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  29.04 
 
 		 340 aa  93.2  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.18 
 
 		 318 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.18 
 
 		 318 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.47 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.36 
 
 		 998 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.74 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  28.78 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  22.6 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.52 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.52 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  27 
 
 		 340 aa  89.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.22 
 
 		 307 aa  89  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>