270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4144 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  94.82 
 
 		 309 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  92.88 
 
 		 309 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  81.23 
 
 		 308 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.85 
 
 		 305 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  54.49 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  50.49 
 
 		 307 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.42 
 
 		 317 aa  311  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  51.29 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  49.17 
 
 		 323 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  50 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0864  gluconolactonase, putative  44.55 
 
 		 286 aa  238  9e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.05 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.59 
 
 		 307 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.1 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.57 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.49 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2741  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.8 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.49 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  28.28 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.52 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.52 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.15 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  27.92 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.49 
 
 		 318 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.49 
 
 		 318 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.84 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.84 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.71 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.36 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  25.97 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.19 
 
 		 313 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.43 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.85 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1102  gluconolactonase, putative  41.98 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.34 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  28.81 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  27.81 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  27.57 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.81 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.19 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  26.9 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  26.43 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  25.19 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  28.48 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  29.6 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  25.19 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.73 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  24.19 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0186  gluconolactonase  28.45 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  24.22 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  24.51 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  24.19 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  23.61 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2571  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.86 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233694  normal  0.0110739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  24.52 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  24.57 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  26.18 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  23.91 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0220  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.11 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  21.5 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.69 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  28.64 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.56 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724481  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  25.42 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.69 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  24.67 
 
 		 533 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  25.96 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.25 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0122  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.17 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271646  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  22.82 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  33.94 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000291446  hitchhiker  0.0000011261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  22.79 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  23.75 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  26.09 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5077  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.52 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167981  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  24.11 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  25.16 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0479  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.77 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  35.34 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.33 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  23.45 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.45 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1935  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.23 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  32.02 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  25 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  25 
 
 		 545 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.18 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  24.17 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  22.59 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29900  gluconolactonase  33.11 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  23.03 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  23.43 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  23.79 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0524  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.07 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1240  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.57 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.138164 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  25.41 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  25.82 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.59 
 
 		 569 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  25.72 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>