155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1414 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  48.95 
 
 
312 aa  245  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3590  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  46.21 
 
 
281 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  34.46 
 
 
280 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  36.1 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  29.79 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  31.51 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.61 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4863  strictosidine synthase  31.63 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0592585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.91 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.7 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.7 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.81 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  30.49 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  31.71 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  31.4 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  31.4 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.39 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  34.09 
 
 
510 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  28.99 
 
 
304 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1525  hypothetical protein  28.95 
 
 
391 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.568964  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.55 
 
 
313 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.33 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.33 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.02 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.02 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.5 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  29.71 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.46 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.55 
 
 
1750 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  26.29 
 
 
346 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.05 
 
 
309 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  28.96 
 
 
353 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  29.09 
 
 
354 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.5 
 
 
579 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.99 
 
 
309 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3292  inner-membrane translocator  25.69 
 
 
706 aa  58.9  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0638637  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.09 
 
 
526 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4828  ABC transporter  25 
 
 
707 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  31.86 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  28.96 
 
 
353 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.89 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  31.82 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  29.46 
 
 
1293 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.28 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.02 
 
 
307 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  30.05 
 
 
380 aa  56.6  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  28.63 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.46 
 
 
282 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  28.04 
 
 
292 aa  55.8  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1822  gluconolactonase  28.74 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.09 
 
 
299 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.31 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1452  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.95 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684281  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  29.81 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6052  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.05 
 
 
340 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  28.7 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1635  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.76 
 
 
545 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  29.18 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  29.56 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  29.34 
 
 
543 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  21.61 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  28.18 
 
 
296 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  28.63 
 
 
297 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
719 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2603  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  27.35 
 
 
331 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.46 
 
 
531 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  25.12 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.55 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  29.09 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  29.09 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.89 
 
 
581 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  29.09 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.21 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  23.81 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3570  superoxide dismutase  34.36 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  30.29 
 
 
538 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3429  strictosidine synthase  23.42 
 
 
358 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.29 
 
 
538 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  28.48 
 
 
304 aa  49.7  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.32 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2345  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.96 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0169935  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.69 
 
 
2114 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  24.38 
 
 
542 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  28.57 
 
 
404 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.09 
 
 
327 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.87 
 
 
529 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.12 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.87 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.77 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  32.1 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.71 
 
 
550 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3573  hypothetical protein  33.33 
 
 
367 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0820856  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  27.37 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  31.32 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.71 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  28.1 
 
 
502 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0906  gluconolactonase  23.65 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4855  strictosidine synthase  25 
 
 
599 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.73 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>