88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6052 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6052  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 		 340 aa  680    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  40.83 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  40.83 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4863  strictosidine synthase  40.83 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0592585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  40.06 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4855  strictosidine synthase  37.61 
 
 		 599 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  43.39 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  42 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  38.91 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  37.54 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  37.54 
 
 		 353 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  36.15 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01780  hypothetical protein  32.14 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3429  strictosidine synthase  30.85 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  35.86 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3130  strictosidine synthase  32.54 
 
 		 358 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3292  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 706 aa  116  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0638637  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1671  hypothetical protein  34.37 
 
 		 357 aa  112  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387951  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3535  inner-membrane translocator  28.11 
 
 		 704 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805371  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4828  ABC transporter  27.65 
 
 		 707 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  28.11 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.31 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.9 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.9 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.67 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  26.32 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  28.78 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  29.61 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.91 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.29 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.29 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.63 
 
 		 309 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.64 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.39 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.39 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0908  gluconolactonase  24.92 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.17943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  28.1 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2303  gluconolactonase  28.5 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.37 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44479  predicted protein  25.89 
 
 		 453 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00279246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.18 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  26.63 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.05 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.25 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2553  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  22.04 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  43.42 
 
 		 283 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  43.42 
 
 		 283 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1002  gluconolactonase  30.04 
 
 		 295 aa  52.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.968927  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  43.42 
 
 		 283 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  26.96 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.24 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  29.3 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  27.04 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  29.3 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  32.08 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  29.3 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  29.3 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  29.3 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.81 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  29.63 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.37 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  25.63 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  26.26 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0906  gluconolactonase  27.27 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3293  strictosidine synthase  25.53 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894775  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4827  hypothetical protein  25.35 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639685  normal  0.827203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  29.56 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  25.25 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  26.4 
 
 		 323 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  25.25 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  22.89 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.89 
 
 		 273 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  22.5 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.96 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  23 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  25.37 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6822  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.9 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  30.25 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  24.54 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  24.12 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  27.73 
 
 		 316 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  23.27 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  26.8 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  29.41 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  23.83 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  24.19 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4633  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.86 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>