87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2429 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  100 
 
 
380 aa  768    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  34.78 
 
 
363 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  35.31 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  34.23 
 
 
353 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  34.12 
 
 
354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01780  hypothetical protein  30.77 
 
 
384 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3429  strictosidine synthase  27.57 
 
 
358 aa  143  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  34.75 
 
 
363 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3130  strictosidine synthase  31.32 
 
 
358 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4855  strictosidine synthase  31.14 
 
 
599 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4863  strictosidine synthase  29.91 
 
 
335 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0592585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3292  inner-membrane translocator  28.05 
 
 
706 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0638637  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  28.36 
 
 
327 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4828  ABC transporter  27.99 
 
 
707 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3535  inner-membrane translocator  29.52 
 
 
704 aa  97.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805371  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  25.75 
 
 
337 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  25.75 
 
 
337 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  26.87 
 
 
337 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6052  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.11 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  24.56 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.96 
 
 
334 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  32.05 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  31.41 
 
 
281 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1671  hypothetical protein  26.61 
 
 
357 aa  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387951  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  30.08 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.31 
 
 
307 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  26.56 
 
 
280 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.05 
 
 
312 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44479  predicted protein  23.08 
 
 
453 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00279246  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  27.33 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.5 
 
 
268 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3534  strictosidine synthase  26.72 
 
 
400 aa  57  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.05 
 
 
279 aa  56.6  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  29.14 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  30.06 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.46 
 
 
307 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.11 
 
 
282 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.07 
 
 
273 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.06 
 
 
318 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.06 
 
 
318 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.47 
 
 
298 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.47 
 
 
298 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  34.04 
 
 
314 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  31.34 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  26.09 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  26.57 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.75 
 
 
309 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.28 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4827  hypothetical protein  27.39 
 
 
365 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639685  normal  0.827203 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  26.42 
 
 
786 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  30.47 
 
 
307 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  30.22 
 
 
323 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  30.1 
 
 
305 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  30.37 
 
 
310 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.95 
 
 
291 aa  46.6  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  33.33 
 
 
283 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  33.33 
 
 
283 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  33.33 
 
 
283 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.28 
 
 
309 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  31.67 
 
 
366 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  28.57 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  28.57 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3293  strictosidine synthase  32.43 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894775  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  27.27 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.28 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3531  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  26.8 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.37 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  30.57 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.28 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  31.96 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1418  hypothetical protein  31.68 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.663029  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  27.39 
 
 
304 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  25.36 
 
 
295 aa  44.3  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  26.35 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  30.22 
 
 
340 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.88 
 
 
317 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  29.69 
 
 
307 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30 
 
 
289 aa  43.5  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.72815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  31.3 
 
 
299 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  33.33 
 
 
323 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  39.71 
 
 
546 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.45 
 
 
309 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.07 
 
 
303 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04004  lactonohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08990)  31.4 
 
 
324 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162257  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  30.87 
 
 
477 aa  43.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.18 
 
 
299 aa  43.1  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  29.3 
 
 
545 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>