15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3534 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3534  strictosidine synthase  100 
 
 		 400 aa  793    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4827  hypothetical protein  40.47 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639685  normal  0.827203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3293  strictosidine synthase  37.34 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894775  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  25.62 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  26.03 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4828  ABC transporter  25.33 
 
 		 707 aa  80.1  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  25.77 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3292  inner-membrane translocator  23.53 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0638637  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3535  inner-membrane translocator  24.33 
 
 		 704 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805371  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3429  strictosidine synthase  23.83 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  24.87 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  26.72 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3130  strictosidine synthase  24 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01780  hypothetical protein  22.1 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  26.47 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>