23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44479 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44479  predicted protein  100 
 
 		 453 aa  931    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00279246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  34.93 
 
 		 353 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  33.9 
 
 		 353 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  29.83 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  32.04 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3429  strictosidine synthase  31.43 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01780  hypothetical protein  30.28 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4828  ABC transporter  27.89 
 
 		 707 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  31.82 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3535  inner-membrane translocator  24.85 
 
 		 704 aa  84.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805371  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  27.94 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3292  inner-membrane translocator  24.56 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0638637  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3130  strictosidine synthase  26.9 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  28.57 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  27.16 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  26.87 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  26.87 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4863  strictosidine synthase  26.83 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0592585 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  23.08 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1671  hypothetical protein  29.15 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387951  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4855  strictosidine synthase  26.24 
 
 		 599 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6052  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.89 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.87 
 
 		 275 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>