36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0368 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0368  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4855  strictosidine synthase  69.93 
 
 		 599 aa  195  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4177  hypothetical protein  82.93 
 
 		 109 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4094  hypothetical protein  82.93 
 
 		 109 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0329  hypothetical protein  81.71 
 
 		 110 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3680  strictosidine synthase  36.9 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105851  normal  0.330915 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3023  hypothetical protein  41.33 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0652  hypothetical protein  45.68 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2386  hypothetical protein  41.57 
 
 		 115 aa  62  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1634  hypothetical protein  43.9 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0956  hypothetical protein  40.21 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3416  hypothetical protein  58.7 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199537  normal  0.0728248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2194  hypothetical protein  56.25 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1406  putative secreted protein  48.48 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0449246  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4171  hypothetical protein  51.56 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0787775  normal  0.908625 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3713  hypothetical protein  42.17 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1264  hypothetical protein  44.44 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4507  hypothetical protein  44 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2345  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000024781  unclonable  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0675  hypothetical protein  54.17 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1192  hypothetical protein  57.78 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2940  hypothetical protein  55.32 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1172  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  48.44 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59860  putative type III effector Hop protein  44 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114799  hitchhiker  0.000000000000152109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0510  hypothetical protein  39.45 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3015  hypothetical protein  48.21 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3322  hypothetical protein  53.19 
 
 		 111 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36200  Plasmid hypothetical protein, RAQPRD  41.33 
 
 		 118 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0443  hypothetical protein  35.48 
 
 		 125 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2851  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  48.89 
 
 		 116 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1756  hypothetical protein  38.89 
 
 		 107 aa  49.7  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0869  hypothetical protein  46.81 
 
 		 121 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1450  hypothetical protein  47.27 
 
 		 120 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1975  hypothetical protein  43.86 
 
 		 106 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.793487  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0640  hypothetical protein  44.44 
 
 		 100 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>