More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2642 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2642  inner-membrane translocator  100 
 
 		 348 aa  664    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  40.36 
 
 		 334 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  40.25 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  39.88 
 
 		 334 aa  199  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  39.88 
 
 		 334 aa  199  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  42.07 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  39.67 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40.33 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40.33 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40.33 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40.33 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 311 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  40 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  40 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 315 aa  192  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  40.49 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  36.73 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  38.53 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 346 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  37.04 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  36.42 
 
 		 339 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  40.77 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  38.8 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  37.61 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  37.46 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  40.43 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  36.36 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.04 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.04 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.04 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  36.84 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  37.26 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  37.99 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  36.98 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  36.98 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  36.98 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  36.56 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37.06 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3208  L-arabinose transporter permease protein  36.66 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.11 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  36.48 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.16 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  42.91 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 343 aa  175  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  36.89 
 
 		 342 aa  175  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 		 342 aa  175  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  36.89 
 
 		 342 aa  175  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  37.85 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  39.07 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  36.73 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 324 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.28 
 
 		 350 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 		 835 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  36.47 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  36.47 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  36.47 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  36.47 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  36.47 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.27 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0047  L-arabinose transporter permease protein  36.98 
 
 		 339 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  35.83 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  37.83 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  38.19 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  38.94 
 
 		 310 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1021  L-arabinose transporter permease protein  34.32 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  35.53 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  34.86 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  37.25 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  41.47 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  41.47 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  34.29 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  41.47 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  41.47 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  33.33 
 
 		 335 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.61 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  34.48 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  35.8 
 
 		 321 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  35.8 
 
 		 321 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  35.86 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  35.8 
 
 		 321 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  35.8 
 
 		 321 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>