37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1036 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  43.75 
 
 		 642 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  29.01 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  28.21 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0841  hypothetical protein  32.43 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  28.21 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  30.35 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1011  periplasmic ATP/GTP-binding protein  28.77 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  31.11 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  26.05 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  31.46 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  30.51 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.39 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0066  putative ATP/GTP-binding protein  30.36 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0453  periplasmic ATP/GTP-binding protein  28.62 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.879062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.03 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  29.49 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.62 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.74 
 
 		 306 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  29.23 
 
 		 448 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  29.93 
 
 		 447 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.82 
 
 		 386 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  29.05 
 
 		 447 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  29.33 
 
 		 438 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  24.87 
 
 		 510 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.1 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  28.06 
 
 		 363 aa  45.8  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  28.28 
 
 		 444 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  27.91 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  27.14 
 
 		 448 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  27.14 
 
 		 448 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  26.21 
 
 		 446 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  28.67 
 
 		 435 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  31.06 
 
 		 343 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  25.4 
 
 		 652 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  31.87 
 
 		 538 aa  42.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>