17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0810 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  79.67 
 
 
567 aa  711    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  72.85 
 
 
451 aa  676    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0826  hypothetical protein  75.38 
 
 
470 aa  703    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.114737  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  81.22 
 
 
916 aa  708    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0810  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  949    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  25.83 
 
 
415 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.23 
 
 
582 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
1380 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  54.35 
 
 
807 aa  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  27.19 
 
 
503 aa  47  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.86 
 
 
998 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676998  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3544  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.78 
 
 
451 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.502732  normal  0.506953 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00779  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11980)  40 
 
 
781 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913287  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  37.68 
 
 
547 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3592  hypothetical protein  48.78 
 
 
528 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237633  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 
479 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2527  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.63 
 
 
847 aa  43.5  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>