270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1336 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  77.25 
 
 		 451 aa  652    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  100 
 
 		 567 aa  1142    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  92.64 
 
 		 916 aa  863    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0826  hypothetical protein  73.36 
 
 		 470 aa  664    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.114737  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0810  hypothetical protein  79.67 
 
 		 464 aa  694    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  55.32 
 
 		 1732 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  57.61 
 
 		 3295 aa  100  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  49.14 
 
 		 615 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  49.15 
 
 		 560 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  50.88 
 
 		 1667 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  49.18 
 
 		 1120 aa  98.2  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  47.29 
 
 		 963 aa  97.4  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  50 
 
 		 2000 aa  97.8  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  56.82 
 
 		 2554 aa  97.8  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  49.18 
 
 		 1969 aa  97.4  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  61.25 
 
 		 752 aa  97.1  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  49.18 
 
 		 1882 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  48.6 
 
 		 528 aa  95.9  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  49.57 
 
 		 1094 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  59.26 
 
 		 644 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  55.56 
 
 		 848 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  56.52 
 
 		 1842 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  58.14 
 
 		 735 aa  94.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  54.02 
 
 		 1361 aa  94.7  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  58.02 
 
 		 561 aa  94.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  44.07 
 
 		 685 aa  94.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  44.92 
 
 		 2272 aa  94  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  55.56 
 
 		 2036 aa  94  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  47.54 
 
 		 1682 aa  94  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  57.5 
 
 		 859 aa  93.6  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  50.56 
 
 		 679 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  55.56 
 
 		 1241 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  57.5 
 
 		 551 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  48.04 
 
 		 958 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  58.97 
 
 		 791 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  54.44 
 
 		 978 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  48.25 
 
 		 581 aa  92  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  46.72 
 
 		 675 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  49.04 
 
 		 669 aa  92  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  47.27 
 
 		 1300 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  49.49 
 
 		 1236 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  46.6 
 
 		 1862 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  52.27 
 
 		 2122 aa  91.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  43.9 
 
 		 547 aa  91.3  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  54.65 
 
 		 910 aa  90.5  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  53.33 
 
 		 575 aa  90.5  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  56.96 
 
 		 519 aa  90.1  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  56.79 
 
 		 941 aa  90.1  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  52.44 
 
 		 1931 aa  89.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  59.49 
 
 		 1356 aa  89.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  53.06 
 
 		 930 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  58.23 
 
 		 713 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1282 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  58.23 
 
 		 658 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  53.57 
 
 		 816 aa  88.2  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  50 
 
 		 1092 aa  88.2  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  49.46 
 
 		 184 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  54.55 
 
 		 1387 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  60.76 
 
 		 996 aa  84.7  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.43 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  53.16 
 
 		 530 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  44.17 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  50 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  46.15 
 
 		 1380 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  41.98 
 
 		 1231 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  44.79 
 
 		 1528 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  48.05 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  49.35 
 
 		 838 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  48.51 
 
 		 1531 aa  80.5  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  52.44 
 
 		 1667 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  42.96 
 
 		 1328 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  50.59 
 
 		 870 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  45.98 
 
 		 769 aa  79.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  43.93 
 
 		 802 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  42.62 
 
 		 930 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  41.28 
 
 		 971 aa  77.4  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  49.41 
 
 		 786 aa  77.8  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  51.9 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  50 
 
 		 465 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  41.86 
 
 		 1189 aa  76.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.67 
 
 		 594 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  48.24 
 
 		 845 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  50.59 
 
 		 719 aa  75.1  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  50.63 
 
 		 1830 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  47.57 
 
 		 1311 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  50.6 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  43.64 
 
 		 1783 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  28.14 
 
 		 869 aa  73.9  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  50 
 
 		 561 aa  73.9  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  41.44 
 
 		 1042 aa  73.9  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  45.24 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  39.45 
 
 		 1056 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  50 
 
 		 861 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  47.62 
 
 		 840 aa  72  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  45.57 
 
 		 777 aa  71.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  36.18 
 
 		 1011 aa  71.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  54.05 
 
 		 819 aa  70.5  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  44.55 
 
 		 819 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  48.19 
 
 		 823 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  50 
 
 		 929 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>