More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1686 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 1056 aa  2150    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1890  cell surface protein  44.66 
 
 		 671 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 		 1121 aa  389  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.44 
 
 		 746 aa  353  8e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1059  hypothetical protein  37.23 
 
 		 867 aa  335  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.724873  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2494  cell surface protein  42.42 
 
 		 462 aa  302  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.909338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  46.77 
 
 		 1035 aa  247  6.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  38.84 
 
 		 777 aa  234  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  30.07 
 
 		 595 aa  197  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  54.94 
 
 		 930 aa  175  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  33.49 
 
 		 735 aa  172  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  38.19 
 
 		 1092 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  52 
 
 		 958 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5141  Proprotein convertase P  31.52 
 
 		 938 aa  157  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.488081  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  40.38 
 
 		 547 aa  152  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46087  predicted protein  29.98 
 
 		 907 aa  152  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  31.9 
 
 		 471 aa  148  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  31.12 
 
 		 838 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4222  hypothetical protein  32.59 
 
 		 1233 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.514353  normal  0.0934006 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  33.43 
 
 		 1931 aa  145  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  31.4 
 
 		 940 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  32.56 
 
 		 810 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4257  fibronectin type III domain-containing protein  30.06 
 
 		 634 aa  131  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.735386  normal  0.703985 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3101  putative serine protease protein  26.9 
 
 		 664 aa  131  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.672072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  31.87 
 
 		 433 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  42.57 
 
 		 869 aa  128  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0770  hypothetical protein  29.79 
 
 		 953 aa  127  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  31.27 
 
 		 724 aa  127  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2169  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.42 
 
 		 818 aa  125  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  52.63 
 
 		 479 aa  125  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  33.87 
 
 		 1001 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.41 
 
 		 594 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  32.11 
 
 		 709 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  28.57 
 
 		 954 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  30.28 
 
 		 810 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  49.11 
 
 		 488 aa  115  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  36.92 
 
 		 749 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  35.53 
 
 		 505 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  31.73 
 
 		 960 aa  106  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  27.81 
 
 		 697 aa  106  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  65.75 
 
 		 387 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_003296  RS03876  putative serine protease protein  27.16 
 
 		 663 aa  105  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  34.95 
 
 		 461 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  49.56 
 
 		 735 aa  102  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  38.38 
 
 		 564 aa  101  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  63.38 
 
 		 579 aa  101  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  28.44 
 
 		 698 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  56.41 
 
 		 831 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.9 
 
 		 547 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  55.42 
 
 		 361 aa  100  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  59.76 
 
 		 561 aa  100  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  61.64 
 
 		 668 aa  100  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  28.74 
 
 		 919 aa  100  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  68.75 
 
 		 581 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  52.17 
 
 		 1682 aa  99  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  69.84 
 
 		 522 aa  99  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  53.26 
 
 		 1969 aa  98.6  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  52.17 
 
 		 1882 aa  98.6  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  24.8 
 
 		 831 aa  98.6  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  45.04 
 
 		 676 aa  98.2  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  68.75 
 
 		 403 aa  97.8  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  51.09 
 
 		 1120 aa  97.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  52.17 
 
 		 2000 aa  97.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  51.11 
 
 		 791 aa  97.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  60.53 
 
 		 787 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  50.54 
 
 		 2036 aa  96.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  52.17 
 
 		 1300 aa  96.3  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  65.62 
 
 		 627 aa  96.3  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  47.06 
 
 		 551 aa  96.3  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  52.08 
 
 		 848 aa  96.3  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  46.02 
 
 		 669 aa  95.5  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  53.54 
 
 		 2122 aa  95.9  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  51.09 
 
 		 2272 aa  95.1  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  50.54 
 
 		 1842 aa  95.1  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  41.6 
 
 		 1862 aa  95.1  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  49.46 
 
 		 561 aa  95.1  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  50.54 
 
 		 184 aa  94.7  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  51.58 
 
 		 2554 aa  94  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  46.61 
 
 		 1236 aa  94  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  60.56 
 
 		 468 aa  94.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  49.04 
 
 		 910 aa  93.6  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  42.06 
 
 		 1094 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  50.52 
 
 		 1667 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  50 
 
 		 978 aa  92.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  40.91 
 
 		 3295 aa  92.4  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  48.31 
 
 		 644 aa  92  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  55.56 
 
 		 575 aa  92  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  42.61 
 
 		 658 aa  91.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  37.6 
 
 		 859 aa  91.3  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  43.48 
 
 		 685 aa  91.3  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  42.45 
 
 		 713 aa  90.5  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  47.31 
 
 		 1241 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  46.74 
 
 		 752 aa  89.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  45.92 
 
 		 560 aa  89.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  43.22 
 
 		 679 aa  89.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  42.86 
 
 		 581 aa  89.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  34.71 
 
 		 375 aa  89.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  27.87 
 
 		 892 aa  89  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  51.61 
 
 		 1361 aa  89  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  59.38 
 
 		 391 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>