281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1955 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  100 
 
 		 1282 aa  2570    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  47.29 
 
 		 1094 aa  566  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  45.27 
 
 		 1667 aa  536  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  39.04 
 
 		 1862 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  44.03 
 
 		 1682 aa  486  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  44.97 
 
 		 963 aa  479  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  41.34 
 
 		 1361 aa  477  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  43.07 
 
 		 2272 aa  463  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  46.43 
 
 		 1842 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  41.02 
 
 		 941 aa  439  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  38.04 
 
 		 1356 aa  432  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  45.14 
 
 		 978 aa  433  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  37.42 
 
 		 1236 aa  427  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  50 
 
 		 735 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  43.1 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  45.08 
 
 		 528 aa  400  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  47.97 
 
 		 752 aa  396  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  40.81 
 
 		 838 aa  376  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  44.31 
 
 		 2036 aa  366  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  45.65 
 
 		 575 aa  366  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  45.24 
 
 		 1882 aa  364  8e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  42.86 
 
 		 530 aa  358  5e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  44.56 
 
 		 2122 aa  354  8e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  44.51 
 
 		 2000 aa  353  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  38.34 
 
 		 1667 aa  350  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  49.74 
 
 		 859 aa  348  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  41.62 
 
 		 930 aa  348  3e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  29.74 
 
 		 1528 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  44.07 
 
 		 2554 aa  337  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  35.85 
 
 		 1732 aa  326  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  48.14 
 
 		 1300 aa  323  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  48.35 
 
 		 713 aa  315  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  34.96 
 
 		 1387 aa  314  7.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  47.88 
 
 		 675 aa  313  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  46.9 
 
 		 679 aa  312  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  47.17 
 
 		 685 aa  312  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  48.37 
 
 		 669 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  48.63 
 
 		 658 aa  305  4.0000000000000003e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  37.57 
 
 		 958 aa  305  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  46.67 
 
 		 1120 aa  296  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  46.42 
 
 		 1969 aa  296  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  48.35 
 
 		 1241 aa  295  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  48.75 
 
 		 460 aa  292  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  31.74 
 
 		 1783 aa  285  4.0000000000000003e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.22 
 
 		 861 aa  273  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  32.11 
 
 		 1011 aa  270  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  30.09 
 
 		 2176 aa  264  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  50.36 
 
 		 581 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  48.55 
 
 		 615 aa  245  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  46.98 
 
 		 551 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  48.18 
 
 		 3295 aa  239  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  43.92 
 
 		 971 aa  238  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  44.55 
 
 		 910 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  31.82 
 
 		 1814 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  45.49 
 
 		 547 aa  235  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  46.55 
 
 		 791 aa  235  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  30.01 
 
 		 952 aa  227  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.37 
 
 		 823 aa  225  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  28.88 
 
 		 865 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  39.27 
 
 		 869 aa  218  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  39.25 
 
 		 840 aa  216  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  37.7 
 
 		 870 aa  213  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  27.4 
 
 		 1606 aa  213  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  38.56 
 
 		 719 aa  213  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  38.68 
 
 		 845 aa  211  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  35.92 
 
 		 802 aa  209  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  31.02 
 
 		 1620 aa  210  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  39.8 
 
 		 443 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.47 
 
 		 786 aa  198  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  33.82 
 
 		 439 aa  194  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  36.7 
 
 		 1292 aa  187  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  42.66 
 
 		 930 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  44.16 
 
 		 777 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  37.23 
 
 		 929 aa  186  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  29.59 
 
 		 1602 aa  184  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.8 
 
 		 819 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  53.29 
 
 		 184 aa  174  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  52.63 
 
 		 644 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  52.63 
 
 		 560 aa  169  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  29.97 
 
 		 1531 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  38.57 
 
 		 1095 aa  166  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  40.93 
 
 		 2552 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  38.73 
 
 		 408 aa  159  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  39.22 
 
 		 1189 aa  158  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  31.83 
 
 		 1987 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  39.45 
 
 		 938 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  52.6 
 
 		 1328 aa  154  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  29.98 
 
 		 1380 aa  153  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  38.6 
 
 		 821 aa  152  5e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  45.41 
 
 		 519 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  51.18 
 
 		 1231 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  43.75 
 
 		 500 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  30.93 
 
 		 734 aa  147  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  47.57 
 
 		 996 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  37.84 
 
 		 816 aa  140  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  42.02 
 
 		 1931 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  39.13 
 
 		 848 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  47.93 
 
 		 940 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  46.2 
 
 		 819 aa  129  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  42.94 
 
 		 400 aa  129  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>