More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0420 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0420  PKD  100 
 
 
1236 aa  2471    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  39 
 
 
1094 aa  433  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  45.96 
 
 
1862 aa  411  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  36.87 
 
 
1282 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  46.68 
 
 
1842 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  44.83 
 
 
2272 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  36.66 
 
 
1667 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  45.37 
 
 
1361 aa  385  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  45.07 
 
 
978 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  44.18 
 
 
1682 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  37.9 
 
 
725 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  46.3 
 
 
963 aa  365  3e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  44 
 
 
561 aa  343  9e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  37.56 
 
 
941 aa  334  5e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  43.81 
 
 
575 aa  331  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  36.74 
 
 
1092 aa  327  9e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  42.24 
 
 
475 aa  319  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  32.72 
 
 
1528 aa  319  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  45.35 
 
 
752 aa  317  7e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  46.9 
 
 
530 aa  317  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  45.39 
 
 
2036 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  43.02 
 
 
735 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  42.79 
 
 
2122 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  45.6 
 
 
2554 aa  308  6e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  45.45 
 
 
528 aa  298  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  42.86 
 
 
2000 aa  297  8e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  43.79 
 
 
1356 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  42.18 
 
 
1882 aa  288  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  36.12 
 
 
497 aa  283  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  34.82 
 
 
838 aa  281  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  56.52 
 
 
910 aa  281  7e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  39.58 
 
 
1783 aa  277  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  54.51 
 
 
859 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  37.18 
 
 
1667 aa  274  7e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  35.63 
 
 
496 aa  270  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  51.14 
 
 
713 aa  264  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  53.57 
 
 
791 aa  264  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  54 
 
 
581 aa  260  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  53.54 
 
 
669 aa  260  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  50.92 
 
 
675 aa  258  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  55.64 
 
 
1732 aa  258  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  52.99 
 
 
679 aa  257  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  40.41 
 
 
1387 aa  257  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  52.19 
 
 
551 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  52.99 
 
 
685 aa  254  9.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  48.94 
 
 
615 aa  253  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  52.08 
 
 
1300 aa  251  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  52.17 
 
 
1120 aa  250  9e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  52.78 
 
 
1969 aa  250  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  48.25 
 
 
1241 aa  249  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  53.36 
 
 
547 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  50.4 
 
 
658 aa  244  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  41.97 
 
 
930 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  30.93 
 
 
1814 aa  238  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  35.87 
 
 
958 aa  238  7e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  52.26 
 
 
460 aa  235  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  35.13 
 
 
2353 aa  234  8.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  33.51 
 
 
1011 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  46.13 
 
 
930 aa  197  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  46.97 
 
 
861 aa  197  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  41.37 
 
 
439 aa  195  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  34.09 
 
 
2176 aa  189  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  29.02 
 
 
952 aa  186  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  53.33 
 
 
3295 aa  184  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  30 
 
 
865 aa  183  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  42.05 
 
 
870 aa  183  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  51.34 
 
 
560 aa  182  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  38.37 
 
 
869 aa  182  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  41.2 
 
 
802 aa  177  8e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  42.57 
 
 
840 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  41.56 
 
 
2552 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  54.71 
 
 
184 aa  175  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.36 
 
 
786 aa  172  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  38.57 
 
 
971 aa  172  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  37.16 
 
 
719 aa  171  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  52.73 
 
 
644 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  41.87 
 
 
819 aa  166  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  38.7 
 
 
821 aa  165  5.0000000000000005e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  39.13 
 
 
1292 aa  164  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  35.59 
 
 
777 aa  163  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  39.92 
 
 
929 aa  161  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  41.25 
 
 
1095 aa  160  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  29.83 
 
 
684 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  50.28 
 
 
519 aa  159  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  25.9 
 
 
1620 aa  159  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  35.92 
 
 
1531 aa  157  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  42.48 
 
 
443 aa  157  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  51.63 
 
 
626 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  51.93 
 
 
996 aa  154  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  44.27 
 
 
500 aa  152  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  41.52 
 
 
1931 aa  151  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  36.68 
 
 
823 aa  151  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  41.04 
 
 
938 aa  151  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  27.11 
 
 
1602 aa  151  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  42.47 
 
 
848 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  47.4 
 
 
816 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  29.4 
 
 
1606 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  32.84 
 
 
1380 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  45.95 
 
 
1231 aa  145  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  44.5 
 
 
940 aa  144  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>