39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0222 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  81.85 
 
 		 496 aa  822    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  100 
 
 		 497 aa  1023    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  40.34 
 
 		 725 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  38.48 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  36.12 
 
 		 1236 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  37.5 
 
 		 1092 aa  264  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  37.15 
 
 		 2353 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  27.39 
 
 		 571 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  29.89 
 
 		 812 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  30.47 
 
 		 1202 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  28.33 
 
 		 1096 aa  71.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  28.96 
 
 		 619 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26082  predicted protein  29.41 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0135575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  28.14 
 
 		 820 aa  60.1  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  27.96 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  25.87 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  26.53 
 
 		 1066 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  29 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1318  peptidase C1A, papain  25.17 
 
 		 492 aa  54.7  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0624769  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4995  predicted protein  26.55 
 
 		 241 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  27.39 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  27.67 
 
 		 1332 aa  51.2  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13119  predicted protein  24.9 
 
 		 241 aa  51.2  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128746  normal  0.100264 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  43.14 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  40.74 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16088  predicted protein  24.09 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00877055 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  41.51 
 
 		 535 aa  49.3  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  48.08 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  24.32 
 
 		 405 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  42.59 
 
 		 308 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  23.79 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  40.38 
 
 		 307 aa  47.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  42.31 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  29.67 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  26.41 
 
 		 934 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  40.38 
 
 		 307 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  39.34 
 
 		 1242 aa  44.3  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf582  hypothetical lipoprotein, cysteine protease  24.92 
 
 		 789 aa  43.5  0.009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.118517  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0638  hypothetical protein  25.54 
 
 		 884 aa  43.5  0.009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.102075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>