More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4412 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1602 aa  3272    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  34.05 
 
 		 1606 aa  791    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  65.61 
 
 		 1620 aa  2186    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  34.76 
 
 		 1094 aa  265  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1667 aa  264  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  26.34 
 
 		 1466 aa  253  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  33.71 
 
 		 2272 aa  252  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  32.24 
 
 		 941 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  34.65 
 
 		 963 aa  226  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  30.24 
 
 		 1862 aa  224  7e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  27.8 
 
 		 1361 aa  219  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  25.4 
 
 		 1528 aa  215  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  33.06 
 
 		 1682 aa  211  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  27.78 
 
 		 1667 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  26.29 
 
 		 1814 aa  197  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.91 
 
 		 1842 aa  188  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1282 aa  186  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  33.06 
 
 		 735 aa  184  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  26.43 
 
 		 2176 aa  181  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  30.27 
 
 		 1371 aa  180  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  31.92 
 
 		 978 aa  174  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  33.81 
 
 		 2554 aa  172  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  35.53 
 
 		 752 aa  162  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  34.07 
 
 		 2122 aa  161  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  25.78 
 
 		 1011 aa  160  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2036 aa  159  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  25.5 
 
 		 1387 aa  158  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  33.41 
 
 		 528 aa  155  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  33.17 
 
 		 2000 aa  154  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  29.24 
 
 		 865 aa  155  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  35.66 
 
 		 1882 aa  154  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  40.68 
 
 		 675 aa  153  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  33.41 
 
 		 575 aa  152  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  29.42 
 
 		 930 aa  152  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  27.48 
 
 		 1236 aa  152  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  31.85 
 
 		 958 aa  151  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  40.68 
 
 		 679 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  29.27 
 
 		 561 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  27.03 
 
 		 1783 aa  149  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  36.1 
 
 		 530 aa  148  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  37.17 
 
 		 713 aa  148  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  39.69 
 
 		 669 aa  148  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  37.35 
 
 		 1300 aa  148  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  41.74 
 
 		 551 aa  147  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  40.91 
 
 		 685 aa  145  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1228 aa  145  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  34.99 
 
 		 859 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  27 
 
 		 952 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  28.35 
 
 		 1987 aa  142  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  41.53 
 
 		 581 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  37.55 
 
 		 1120 aa  139  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  40 
 
 		 547 aa  139  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  36.14 
 
 		 1241 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  28.81 
 
 		 662 aa  137  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  29.04 
 
 		 838 aa  135  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  41.35 
 
 		 1969 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  24.95 
 
 		 650 aa  134  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  38.58 
 
 		 1732 aa  133  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  32.55 
 
 		 1356 aa  133  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  25.42 
 
 		 886 aa  132  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  38.72 
 
 		 3295 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  37.11 
 
 		 615 aa  128  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  24.88 
 
 		 1389 aa  128  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  30.14 
 
 		 861 aa  125  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  40.16 
 
 		 658 aa  125  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  33.03 
 
 		 460 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  38.4 
 
 		 791 aa  125  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  38.1 
 
 		 823 aa  122  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  36.33 
 
 		 910 aa  122  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  32.18 
 
 		 929 aa  122  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  36.75 
 
 		 786 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  33.98 
 
 		 802 aa  118  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  36.15 
 
 		 1292 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  30.53 
 
 		 808 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  36.32 
 
 		 870 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  29.5 
 
 		 1565 aa  115  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  28.41 
 
 		 1162 aa  113  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  36.82 
 
 		 819 aa  112  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  29.53 
 
 		 627 aa  111  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.17 
 
 		 845 aa  108  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1287 aa  108  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  32.85 
 
 		 890 aa  108  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  32.9 
 
 		 719 aa  108  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  35.34 
 
 		 777 aa  108  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  26.48 
 
 		 1057 aa  108  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  34.34 
 
 		 869 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  40.62 
 
 		 644 aa  107  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  31.27 
 
 		 840 aa  107  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  29.12 
 
 		 734 aa  106  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  32.63 
 
 		 1095 aa  105  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  40.24 
 
 		 184 aa  105  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  28.43 
 
 		 1152 aa  104  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  27.12 
 
 		 822 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 642 aa  102  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  38.15 
 
 		 560 aa  101  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1313 aa  98.6  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  34.4 
 
 		 1531 aa  97.8  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  27 
 
 		 799 aa  97.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  29.31 
 
 		 439 aa  97.8  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  33.86 
 
 		 443 aa  96.3  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>