More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6899 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  34.05 
 
 		 1602 aa  793    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 1606 aa  3234    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  34.2 
 
 		 1620 aa  807    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1667 aa  320  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  28.83 
 
 		 1466 aa  296  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  30.8 
 
 		 1094 aa  274  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  30.31 
 
 		 1361 aa  274  8.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  32.53 
 
 		 2272 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  30.73 
 
 		 1862 aa  264  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  26.52 
 
 		 1528 aa  254  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  31.52 
 
 		 941 aa  242  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  27 
 
 		 2176 aa  241  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  27.81 
 
 		 1814 aa  240  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  28.92 
 
 		 1387 aa  238  7e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  34.26 
 
 		 963 aa  230  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  34.67 
 
 		 1667 aa  224  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1682 aa  222  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1282 aa  216  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  28.4 
 
 		 1011 aa  193  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  31.76 
 
 		 1842 aa  192  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  33.26 
 
 		 2554 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  32.67 
 
 		 978 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  32.23 
 
 		 735 aa  181  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  36.14 
 
 		 2036 aa  180  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  34.76 
 
 		 752 aa  180  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  28.47 
 
 		 886 aa  177  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  34.78 
 
 		 1882 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  32.46 
 
 		 575 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  27.46 
 
 		 865 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  34.02 
 
 		 561 aa  173  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  31.13 
 
 		 528 aa  172  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  26.17 
 
 		 2122 aa  172  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  27.91 
 
 		 1371 aa  169  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  34.4 
 
 		 2000 aa  169  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  32.71 
 
 		 958 aa  168  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  33.13 
 
 		 859 aa  164  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  28.06 
 
 		 1389 aa  164  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  32.34 
 
 		 1356 aa  164  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  30.13 
 
 		 1236 aa  163  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 627 aa  163  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1228 aa  160  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  24.9 
 
 		 952 aa  159  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  32.37 
 
 		 530 aa  155  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  32.51 
 
 		 1300 aa  154  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  32.54 
 
 		 675 aa  152  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  27.92 
 
 		 1783 aa  152  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.19 
 
 		 713 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  35.35 
 
 		 1969 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  31.07 
 
 		 861 aa  147  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  32.37 
 
 		 679 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1287 aa  144  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  32.23 
 
 		 1120 aa  143  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  33.53 
 
 		 685 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  33.94 
 
 		 460 aa  142  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  27.24 
 
 		 838 aa  142  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  35.26 
 
 		 1241 aa  141  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  31.96 
 
 		 1987 aa  140  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  32.24 
 
 		 658 aa  140  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  30.94 
 
 		 669 aa  139  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  30.87 
 
 		 734 aa  137  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.52 
 
 		 930 aa  135  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  32.83 
 
 		 869 aa  135  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  29.53 
 
 		 662 aa  134  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  28.21 
 
 		 650 aa  130  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  28.48 
 
 		 3295 aa  128  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  32.25 
 
 		 1565 aa  124  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  34.01 
 
 		 910 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  28.46 
 
 		 885 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.58 
 
 		 547 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  27.14 
 
 		 1057 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  26.4 
 
 		 1162 aa  120  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  33.61 
 
 		 581 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  34.4 
 
 		 551 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  32.94 
 
 		 791 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  27.89 
 
 		 802 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  28.86 
 
 		 870 aa  113  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  31.98 
 
 		 719 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  33.78 
 
 		 786 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  30.82 
 
 		 971 aa  112  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  35.04 
 
 		 823 aa  112  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  25.14 
 
 		 1463 aa  111  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  26.76 
 
 		 890 aa  111  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  32.21 
 
 		 1230 aa  111  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  33.86 
 
 		 443 aa  110  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  35.92 
 
 		 840 aa  110  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  31.46 
 
 		 1732 aa  108  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  28.03 
 
 		 929 aa  107  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  25.9 
 
 		 808 aa  106  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  27.14 
 
 		 845 aa  106  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  30.92 
 
 		 615 aa  104  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  32.93 
 
 		 1292 aa  104  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  26.95 
 
 		 792 aa  103  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  32.95 
 
 		 642 aa  101  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  33.69 
 
 		 930 aa  100  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  33.2 
 
 		 2552 aa  98.6  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  32 
 
 		 777 aa  98.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  26.85 
 
 		 815 aa  97.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  33.99 
 
 		 819 aa  97.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  34.59 
 
 		 408 aa  96.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  26.83 
 
 		 637 aa  97.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>