279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4750 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  100 
 
 
1463 aa  2954    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  27.76 
 
 
2402 aa  251  9e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  30.76 
 
 
2262 aa  205  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  28.57 
 
 
561 aa  174  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  28.16 
 
 
1064 aa  168  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  23.7 
 
 
1804 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  25.38 
 
 
6497 aa  143  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5222  hypothetical protein  30.25 
 
 
386 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  26.86 
 
 
5298 aa  112  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  25.98 
 
 
1163 aa  111  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  24.5 
 
 
1094 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  25.34 
 
 
1606 aa  107  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  25.77 
 
 
2713 aa  106  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  25.52 
 
 
759 aa  103  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  25.05 
 
 
885 aa  103  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.27 
 
 
735 aa  101  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  27.46 
 
 
652 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  26.72 
 
 
2176 aa  97.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  24.7 
 
 
575 aa  95.5  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  27.7 
 
 
1987 aa  95.5  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  26.85 
 
 
1667 aa  94.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  26.55 
 
 
978 aa  94.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  25.15 
 
 
2122 aa  93.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  25.27 
 
 
1682 aa  92.8  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.91 
 
 
1862 aa  92  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  27.95 
 
 
874 aa  91.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  23.84 
 
 
534 aa  90.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  24.29 
 
 
5544 aa  90.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  27.37 
 
 
1667 aa  89.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.04 
 
 
752 aa  89.4  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  25.16 
 
 
1814 aa  89.4  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  27.15 
 
 
528 aa  88.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  25.99 
 
 
561 aa  86.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  26.05 
 
 
2036 aa  85.5  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  26.25 
 
 
1842 aa  85.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  26.54 
 
 
1222 aa  84.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  25.14 
 
 
3794 aa  84.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  25.11 
 
 
4071 aa  82.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  25.26 
 
 
1361 aa  82.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  27 
 
 
679 aa  82.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  32.97 
 
 
532 aa  82.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  25.86 
 
 
958 aa  82  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  26.67 
 
 
1282 aa  80.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  27.34 
 
 
675 aa  80.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.45 
 
 
2272 aa  80.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  23.96 
 
 
540 aa  79.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  27.39 
 
 
535 aa  79.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  23.31 
 
 
1139 aa  77.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  25.69 
 
 
1882 aa  77.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  24.91 
 
 
963 aa  77.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  27.58 
 
 
1547 aa  77.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  25.52 
 
 
890 aa  76.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  25.13 
 
 
1528 aa  76.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  34.02 
 
 
1483 aa  75.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  26.26 
 
 
1300 aa  75.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  27.69 
 
 
669 aa  75.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  28.61 
 
 
658 aa  75.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  26.3 
 
 
859 aa  74.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  23.38 
 
 
650 aa  74.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  27.13 
 
 
1356 aa  73.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  24.14 
 
 
2554 aa  73.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  23.21 
 
 
1620 aa  73.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  26.45 
 
 
713 aa  73.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  24 
 
 
1162 aa  73.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  23.65 
 
 
3958 aa  72.4  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  32.98 
 
 
1732 aa  72  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  24.08 
 
 
941 aa  72  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  28.93 
 
 
547 aa  72  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  22.46 
 
 
4044 aa  71.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  25.79 
 
 
1193 aa  70.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  25.97 
 
 
685 aa  70.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  34.96 
 
 
815 aa  70.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  30.24 
 
 
840 aa  71.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  23.23 
 
 
1602 aa  70.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  26.26 
 
 
2000 aa  70.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  26.8 
 
 
1230 aa  69.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  21.85 
 
 
1057 aa  68.9  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  23.58 
 
 
1371 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  29.62 
 
 
870 aa  68.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  37.08 
 
 
658 aa  67.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  27.5 
 
 
861 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  24.12 
 
 
662 aa  67.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  26.58 
 
 
551 aa  66.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  22.99 
 
 
865 aa  65.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  28.65 
 
 
918 aa  65.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  23.51 
 
 
1916 aa  65.1  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  26.01 
 
 
886 aa  64.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  26.02 
 
 
615 aa  64.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  26.41 
 
 
1969 aa  64.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  27.49 
 
 
1120 aa  63.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  23.65 
 
 
636 aa  63.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  26.96 
 
 
1292 aa  63.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  33.83 
 
 
820 aa  63.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  28.33 
 
 
719 aa  62.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  22.95 
 
 
952 aa  62.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  26.23 
 
 
581 aa  62.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  32.43 
 
 
936 aa  62.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  32.43 
 
 
936 aa  62.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  28.02 
 
 
503 aa  62  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  25.72 
 
 
2833 aa  62.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>