More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1961 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  72.57 
 
 		 870 aa  736    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  55.54 
 
 		 719 aa  642    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 840 aa  1692    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  55.68 
 
 		 845 aa  832    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  55.21 
 
 		 823 aa  529  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  56.18 
 
 		 802 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  52.44 
 
 		 3295 aa  422  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  53.1 
 
 		 2554 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  60.43 
 
 		 1356 aa  389  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  61.58 
 
 		 1732 aa  377  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 777 aa  365  2e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  76.19 
 
 		 1380 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  47.64 
 
 		 819 aa  348  3e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  60.56 
 
 		 786 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  37.27 
 
 		 1387 aa  243  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  40.48 
 
 		 1094 aa  237  9e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  44.06 
 
 		 930 aa  231  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  39.37 
 
 		 2122 aa  228  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  42.39 
 
 		 713 aa  226  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  39.29 
 
 		 859 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  42.99 
 
 		 669 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  40.92 
 
 		 2036 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  40.29 
 
 		 2272 aa  222  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  41.21 
 
 		 679 aa  221  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  39.46 
 
 		 1842 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  40.62 
 
 		 735 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  40.92 
 
 		 1667 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  42.09 
 
 		 675 aa  218  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  37.34 
 
 		 1282 aa  217  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  39.94 
 
 		 752 aa  217  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  41.19 
 
 		 561 aa  217  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  41.3 
 
 		 1300 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  40.75 
 
 		 1682 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  40.15 
 
 		 575 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  39.37 
 
 		 1882 aa  211  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  40.67 
 
 		 528 aa  211  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  42.39 
 
 		 685 aa  211  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  42.61 
 
 		 963 aa  209  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  40.86 
 
 		 2000 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  42.26 
 
 		 658 aa  205  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  38.84 
 
 		 1241 aa  204  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  46.21 
 
 		 547 aa  204  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  37.53 
 
 		 978 aa  204  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  37.37 
 
 		 1862 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  40.11 
 
 		 1969 aa  201  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  45.9 
 
 		 1120 aa  200  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  43.73 
 
 		 530 aa  198  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  40.05 
 
 		 1361 aa  197  9e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  46.06 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  36.73 
 
 		 861 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  39.52 
 
 		 838 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  45.25 
 
 		 958 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  43.39 
 
 		 551 aa  196  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  43.8 
 
 		 791 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  39.11 
 
 		 460 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  38.94 
 
 		 1528 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  42.64 
 
 		 615 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  37.87 
 
 		 941 aa  181  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  39.3 
 
 		 1667 aa  178  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  42.63 
 
 		 1236 aa  177  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  48.43 
 
 		 966 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  42.07 
 
 		 930 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  36.16 
 
 		 869 aa  173  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  43.92 
 
 		 910 aa  173  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  56.46 
 
 		 735 aa  171  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  41.46 
 
 		 2552 aa  154  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  47.31 
 
 		 1234 aa  152  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  52.05 
 
 		 1799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  35.32 
 
 		 971 aa  149  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  49.7 
 
 		 627 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  49.14 
 
 		 1262 aa  146  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  49.13 
 
 		 581 aa  145  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  48.77 
 
 		 184 aa  142  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  42.86 
 
 		 519 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  42.35 
 
 		 644 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  41.39 
 
 		 1095 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  39.18 
 
 		 1292 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  43.24 
 
 		 848 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  47.16 
 
 		 560 aa  138  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  39.02 
 
 		 443 aa  138  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  36.44 
 
 		 1189 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  41.21 
 
 		 1931 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  50 
 
 		 954 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  44.58 
 
 		 500 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  45.18 
 
 		 522 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  33.09 
 
 		 1783 aa  132  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  31.25 
 
 		 952 aa  132  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  46.43 
 
 		 930 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  39.56 
 
 		 739 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  41.99 
 
 		 1231 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  31.71 
 
 		 1011 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  37.59 
 
 		 938 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  46.96 
 
 		 996 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  33.21 
 
 		 439 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  30.41 
 
 		 929 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  48.3 
 
 		 1035 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  46 
 
 		 468 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  45.62 
 
 		 919 aa  121  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  47.55 
 
 		 940 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  33.82 
 
 		 865 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>