293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0424 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0424  PKD  100 
 
 
1292 aa  2649    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  32.63 
 
 
1095 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  30.98 
 
 
929 aa  313  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  29.18 
 
 
1231 aa  311  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  35.16 
 
 
941 aa  261  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  43.32 
 
 
752 aa  250  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  41.83 
 
 
1682 aa  243  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  42.29 
 
 
1969 aa  239  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  38.24 
 
 
735 aa  238  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  42.24 
 
 
1300 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  41.02 
 
 
859 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  41.92 
 
 
1094 aa  233  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  41.74 
 
 
2272 aa  233  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  39.83 
 
 
1667 aa  232  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  41.48 
 
 
2036 aa  231  8e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  41.84 
 
 
679 aa  228  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  40.74 
 
 
1882 aa  226  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  41.92 
 
 
561 aa  225  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.08 
 
 
1842 aa  225  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  40.95 
 
 
713 aa  224  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  39.12 
 
 
675 aa  222  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  39.35 
 
 
1120 aa  223  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  40.71 
 
 
978 aa  222  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  38.07 
 
 
963 aa  221  7e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  41.07 
 
 
1862 aa  220  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  41 
 
 
575 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  40.41 
 
 
685 aa  218  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  41.3 
 
 
2000 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  40.71 
 
 
2122 aa  217  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  41.12 
 
 
1241 aa  216  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  40.95 
 
 
669 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  40.95 
 
 
658 aa  211  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  39.28 
 
 
528 aa  208  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  39.38 
 
 
1361 aa  207  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 
1356 aa  206  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  39.18 
 
 
2554 aa  204  9e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  40.24 
 
 
460 aa  201  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  38.24 
 
 
930 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  44.05 
 
 
581 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  36.58 
 
 
530 aa  191  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  37.72 
 
 
958 aa  191  9e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  41.73 
 
 
551 aa  190  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  37.07 
 
 
1282 aa  186  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  36.44 
 
 
1528 aa  184  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  33.25 
 
 
1732 aa  183  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  42.06 
 
 
791 aa  182  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  40.78 
 
 
547 aa  180  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  39.1 
 
 
1667 aa  179  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  40.15 
 
 
615 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  40.08 
 
 
3295 aa  168  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  37.08 
 
 
861 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  33.42 
 
 
996 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  36.27 
 
 
910 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  39.13 
 
 
1236 aa  164  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  35.67 
 
 
869 aa  164  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  34.54 
 
 
838 aa  163  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2263  hypothetical protein  24.43 
 
 
862 aa  160  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.716746  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2513  hypothetical protein  23.68 
 
 
847 aa  159  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  35.55 
 
 
1387 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  27.52 
 
 
865 aa  153  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  33.91 
 
 
870 aa  146  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  35.58 
 
 
1783 aa  145  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  41.91 
 
 
930 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  37.39 
 
 
786 aa  142  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  36.75 
 
 
819 aa  141  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  39.18 
 
 
840 aa  141  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  33.11 
 
 
971 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  41.94 
 
 
719 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  36.84 
 
 
802 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  35.32 
 
 
823 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.36 
 
 
845 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  33.55 
 
 
821 aa  133  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  34.18 
 
 
777 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2759  hypothetical protein  24.75 
 
 
892 aa  129  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.257016  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  35.1 
 
 
2552 aa  128  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  45.96 
 
 
560 aa  127  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  46.41 
 
 
644 aa  126  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  33.02 
 
 
2176 aa  126  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  33.23 
 
 
952 aa  126  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  30.81 
 
 
1011 aa  125  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  36.6 
 
 
938 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  33.23 
 
 
1814 aa  121  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  40.61 
 
 
184 aa  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  32.48 
 
 
1042 aa  119  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  42.68 
 
 
500 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  36.15 
 
 
1602 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  33.99 
 
 
443 aa  116  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  40.98 
 
 
1311 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  34.02 
 
 
1189 aa  116  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0522  hypothetical protein  22.8 
 
 
941 aa  115  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.057808  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  41.18 
 
 
816 aa  111  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  37.5 
 
 
400 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  30.91 
 
 
439 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  38.58 
 
 
684 aa  110  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  34.32 
 
 
1531 aa  108  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  40.36 
 
 
519 aa  107  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  33.87 
 
 
1620 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.93 
 
 
1606 aa  105  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  38.99 
 
 
1931 aa  103  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2413  hypothetical protein  22.96 
 
 
909 aa  102  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273323  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>