238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2421 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  100 
 
 
443 aa  880    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  39.55 
 
 
859 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  44.41 
 
 
752 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  40.05 
 
 
561 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  42.42 
 
 
1882 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  41.91 
 
 
1682 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  41.71 
 
 
735 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  43.66 
 
 
685 aa  216  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  43.47 
 
 
2036 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  43.4 
 
 
675 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  42.17 
 
 
1300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  44.19 
 
 
1356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  41.73 
 
 
713 aa  212  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  40.16 
 
 
2272 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  39.13 
 
 
1094 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  41.73 
 
 
669 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  44.55 
 
 
528 aa  210  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  41.93 
 
 
1120 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  42.17 
 
 
1842 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  43.77 
 
 
679 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  40.68 
 
 
1361 aa  204  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  41.48 
 
 
1969 aa  202  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  39.85 
 
 
1282 aa  201  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  42.57 
 
 
460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  42.78 
 
 
658 aa  200  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  40.96 
 
 
1667 aa  200  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  40.51 
 
 
1862 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  39.94 
 
 
2122 aa  196  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  39.83 
 
 
2000 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  40.97 
 
 
978 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  40.11 
 
 
575 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  41.69 
 
 
530 aa  193  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  43.83 
 
 
1667 aa  193  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  38.66 
 
 
861 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  41.62 
 
 
1241 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  42.09 
 
 
910 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  38.94 
 
 
958 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  42.56 
 
 
963 aa  187  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  47.15 
 
 
581 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  39.84 
 
 
930 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  40.22 
 
 
2554 aa  180  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  37.8 
 
 
838 aa  180  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  37.43 
 
 
941 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  43.46 
 
 
615 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  42.19 
 
 
547 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  37.6 
 
 
1387 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  47.13 
 
 
3295 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  43.24 
 
 
791 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  45.36 
 
 
1732 aa  169  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  42.58 
 
 
551 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  42.48 
 
 
1236 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  36.33 
 
 
869 aa  151  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.7 
 
 
823 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  33.78 
 
 
1528 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  36.68 
 
 
971 aa  149  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  35.03 
 
 
1011 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  40.94 
 
 
930 aa  142  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  34.51 
 
 
719 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  35.1 
 
 
2176 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  34.57 
 
 
845 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  39.02 
 
 
840 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  40.08 
 
 
870 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.48 
 
 
777 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  38.7 
 
 
2552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  37.01 
 
 
819 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.65 
 
 
786 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  40 
 
 
1095 aa  133  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  47.85 
 
 
644 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  34.03 
 
 
802 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  36.22 
 
 
1783 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  44.79 
 
 
560 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  45.51 
 
 
1231 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  45.06 
 
 
184 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  31.55 
 
 
1814 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  36.2 
 
 
1189 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.25 
 
 
439 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  31.04 
 
 
952 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  44.38 
 
 
500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  35.98 
 
 
1162 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  31.08 
 
 
865 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  34.12 
 
 
929 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  33.99 
 
 
1292 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  45.4 
 
 
519 aa  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  45.12 
 
 
940 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  36.09 
 
 
408 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  32.46 
 
 
1531 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  43.64 
 
 
816 aa  106  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  34.44 
 
 
734 aa  103  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  30.17 
 
 
1606 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  32.49 
 
 
938 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  39.13 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  39.53 
 
 
1931 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  32.34 
 
 
1620 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  30.54 
 
 
517 aa  97.8  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  40 
 
 
586 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  39.6 
 
 
996 aa  96.7  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  32.48 
 
 
1371 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  36.12 
 
 
1602 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  31.65 
 
 
1987 aa  93.2  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  39.01 
 
 
918 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>