More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1970 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 1931 aa  3841    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  41.02 
 
 		 735 aa  248  6.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  36.49 
 
 		 777 aa  229  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  44.02 
 
 		 547 aa  226  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  37.64 
 
 		 940 aa  210  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  46.36 
 
 		 461 aa  204  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  35.8 
 
 		 838 aa  191  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  41.42 
 
 		 1035 aa  181  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  47.32 
 
 		 3295 aa  180  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  49.7 
 
 		 669 aa  169  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  43.88 
 
 		 679 aa  168  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  48.85 
 
 		 1842 aa  168  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  46.67 
 
 		 859 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  48.48 
 
 		 713 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  46.51 
 
 		 1094 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  46.24 
 
 		 1882 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  46.86 
 
 		 1300 aa  166  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  46.47 
 
 		 184 aa  165  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  45.71 
 
 		 978 aa  165  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  45.9 
 
 		 675 aa  164  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  48.8 
 
 		 581 aa  163  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  42.4 
 
 		 752 aa  163  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  49.71 
 
 		 910 aa  162  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  32.37 
 
 		 1969 aa  163  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  45.03 
 
 		 1732 aa  162  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  47.88 
 
 		 561 aa  161  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  48.48 
 
 		 658 aa  160  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  47.88 
 
 		 2036 aa  160  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  46.91 
 
 		 791 aa  160  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  47.16 
 
 		 2554 aa  160  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  41.8 
 
 		 749 aa  160  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  48.48 
 
 		 1120 aa  159  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  46.67 
 
 		 551 aa  159  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1001 aa  159  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  41.52 
 
 		 1236 aa  158  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  48.48 
 
 		 963 aa  158  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  44.57 
 
 		 1682 aa  157  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  44.32 
 
 		 2272 aa  157  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  40.45 
 
 		 930 aa  157  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  47.06 
 
 		 1241 aa  157  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  43.6 
 
 		 1862 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  46.67 
 
 		 575 aa  156  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  45.03 
 
 		 685 aa  154  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  44.32 
 
 		 2122 aa  154  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  46.33 
 
 		 1356 aa  153  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  44 
 
 		 560 aa  153  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  43.18 
 
 		 2000 aa  152  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  47.27 
 
 		 615 aa  152  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  40.68 
 
 		 1092 aa  152  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  45.88 
 
 		 530 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  34.22 
 
 		 810 aa  150  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  45.29 
 
 		 528 aa  149  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  40.59 
 
 		 1667 aa  147  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  42.35 
 
 		 644 aa  146  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  41.8 
 
 		 941 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  42.02 
 
 		 1282 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  43.52 
 
 		 861 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  43.1 
 
 		 1361 aa  143  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  46.39 
 
 		 519 aa  143  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  30.09 
 
 		 960 aa  142  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  42.25 
 
 		 460 aa  139  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  36.07 
 
 		 698 aa  139  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  36.07 
 
 		 697 aa  139  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  41.21 
 
 		 840 aa  139  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  32.67 
 
 		 1056 aa  139  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  39.67 
 
 		 500 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  39.59 
 
 		 1231 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  44.77 
 
 		 869 aa  136  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  45.81 
 
 		 845 aa  135  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  30.22 
 
 		 471 aa  135  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  45.16 
 
 		 802 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  45.86 
 
 		 1667 aa  133  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  43.18 
 
 		 930 aa  133  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  44.52 
 
 		 870 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  39.88 
 
 		 439 aa  132  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  44 
 
 		 996 aa  131  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  46.79 
 
 		 958 aa  131  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  45.51 
 
 		 1311 aa  131  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  38.83 
 
 		 786 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  44.59 
 
 		 719 aa  129  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  31.67 
 
 		 709 aa  129  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  36.07 
 
 		 848 aa  128  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  38.24 
 
 		 823 aa  126  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  42.16 
 
 		 595 aa  126  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  44.12 
 
 		 1328 aa  125  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  39.88 
 
 		 816 aa  125  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  31.12 
 
 		 810 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  36.21 
 
 		 1528 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  34.75 
 
 		 505 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  29.06 
 
 		 724 aa  122  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  40.39 
 
 		 1387 aa  122  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  40.24 
 
 		 1095 aa  120  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  45.81 
 
 		 819 aa  119  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  34.83 
 
 		 1380 aa  118  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  36.92 
 
 		 971 aa  118  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  38.46 
 
 		 684 aa  117  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  29.33 
 
 		 831 aa  117  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  36.59 
 
 		 400 aa  116  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  26.39 
 
 		 638 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  38.58 
 
 		 1783 aa  113  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>