94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0198 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 810 aa  1564    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  70.7 
 
 		 1183 aa  303  8.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  56.35 
 
 		 410 aa  269  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  65.16 
 
 		 1700 aa  252  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  57.85 
 
 		 526 aa  248  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  49.19 
 
 		 368 aa  220  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  44.17 
 
 		 486 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  47.64 
 
 		 482 aa  180  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  43.87 
 
 		 258 aa  177  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  43.46 
 
 		 595 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  34.44 
 
 		 1931 aa  146  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  33.92 
 
 		 838 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  31.19 
 
 		 698 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  38.91 
 
 		 412 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  31.21 
 
 		 461 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  32.43 
 
 		 777 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 1035 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  29.83 
 
 		 697 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  29.55 
 
 		 749 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  35.25 
 
 		 678 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  29.72 
 
 		 1056 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  28.62 
 
 		 724 aa  104  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  33.61 
 
 		 374 aa  101  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  31.12 
 
 		 709 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  33.61 
 
 		 892 aa  94.4  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  34.3 
 
 		 1092 aa  93.2  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  32.19 
 
 		 739 aa  92  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  47.75 
 
 		 1394 aa  91.3  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  33.84 
 
 		 631 aa  88.2  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  32.86 
 
 		 564 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  30.3 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  31.28 
 
 		 735 aa  84.7  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 1121 aa  83.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  28.49 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  34.9 
 
 		 641 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  27.85 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  28.52 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  27.08 
 
 		 620 aa  80.5  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  29.24 
 
 		 595 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  29.1 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45.61 
 
 		 830 aa  79  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1001 aa  77.8  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  33.91 
 
 		 663 aa  77.4  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  24.18 
 
 		 831 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  29.83 
 
 		 635 aa  72.4  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  27.83 
 
 		 805 aa  71.2  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  32.47 
 
 		 810 aa  71.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  53.03 
 
 		 297 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  29.9 
 
 		 940 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  31.72 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  30.7 
 
 		 648 aa  64.3  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  46.85 
 
 		 916 aa  62.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  26.62 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  33.33 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  27.52 
 
 		 638 aa  61.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  29.25 
 
 		 954 aa  60.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  36.11 
 
 		 656 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  31.52 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  26.85 
 
 		 820 aa  57.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  25.51 
 
 		 919 aa  57.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  26.39 
 
 		 892 aa  57  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  51.85 
 
 		 960 aa  56.2  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  32.64 
 
 		 651 aa  55.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  45.31 
 
 		 453 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  27.88 
 
 		 871 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  30.36 
 
 		 245 aa  55.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  51.65 
 
 		 455 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  41.25 
 
 		 1096 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.38 
 
 		 614 aa  52.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  26.67 
 
 		 1332 aa  51.6  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  39.02 
 
 		 671 aa  51.2  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  25.85 
 
 		 410 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  33.82 
 
 		 938 aa  50.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  42.27 
 
 		 551 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.68 
 
 		 746 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 		 846 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  48 
 
 		 356 aa  48.5  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  52.73 
 
 		 444 aa  48.5  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  28.29 
 
 		 2313 aa  48.5  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  33.33 
 
 		 633 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  36.81 
 
 		 625 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.93 
 
 		 425 aa  47.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  24.86 
 
 		 5453 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  31.18 
 
 		 483 aa  47.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  35.56 
 
 		 720 aa  47.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0596  hypothetical protein  32.14 
 
 		 304 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.743466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  40 
 
 		 428 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  42.72 
 
 		 778 aa  46.2  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  40.11 
 
 		 1159 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  35.58 
 
 		 504 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  34.15 
 
 		 489 aa  46.2  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  35.14 
 
 		 682 aa  45.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  45.16 
 
 		 433 aa  44.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.14 
 
 		 257 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>