109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1279 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  80.51 
 
 		 805 aa  1134    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  56.19 
 
 		 831 aa  748    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 892 aa  1724    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  87.19 
 
 		 820 aa  1219    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  34.32 
 
 		 564 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1001 aa  106  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 1121 aa  106  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  24.83 
 
 		 595 aa  95.5  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  30.2 
 
 		 641 aa  91.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  27.94 
 
 		 1931 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  29.58 
 
 		 871 aa  87  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.69 
 
 		 510 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  28.67 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  27.86 
 
 		 940 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  29.74 
 
 		 810 aa  77.4  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  30.36 
 
 		 1092 aa  77.4  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  31.08 
 
 		 635 aa  74.3  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  63.49 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  26.32 
 
 		 1056 aa  72.4  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  32.02 
 
 		 375 aa  72  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  26.29 
 
 		 1332 aa  72  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  34.11 
 
 		 677 aa  71.6  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  62.5 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 777 aa  69.3  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  24.57 
 
 		 5743 aa  68.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  32.3 
 
 		 620 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0098  cell wall anchor domain-containing protein  35.79 
 
 		 520 aa  66.6  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0102  cell wall anchor domain-containing protein  35.79 
 
 		 520 aa  66.6  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  34.29 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  38.74 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.2 
 
 		 735 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  33.92 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  27.67 
 
 		 741 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  22.99 
 
 		 954 aa  62.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  27.24 
 
 		 638 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  30.85 
 
 		 1035 aa  62  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  42.55 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  28.76 
 
 		 1200 aa  61.2  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  27.15 
 
 		 365 aa  60.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  26.01 
 
 		 741 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  23.3 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  25.14 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.14 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.14 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.07 
 
 		 1919 aa  58.9  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  26.12 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  25.14 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  36.11 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  25.14 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  30.61 
 
 		 570 aa  57.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  30.43 
 
 		 1025 aa  57.4  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  26.27 
 
 		 810 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  29.1 
 
 		 513 aa  57  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  30.05 
 
 		 1224 aa  57  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  19.27 
 
 		 459 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  28.7 
 
 		 1242 aa  55.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.49 
 
 		 425 aa  55.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  26.52 
 
 		 382 aa  54.3  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2380  hypothetical protein  25.61 
 
 		 473 aa  53.5  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484558  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  23.89 
 
 		 457 aa  52.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  28.67 
 
 		 14944 aa  52.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  29.35 
 
 		 647 aa  52.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  30.95 
 
 		 409 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  28.89 
 
 		 709 aa  51.6  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.74 
 
 		 458 aa  51.2  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  26.18 
 
 		 919 aa  51.2  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  24.81 
 
 		 499 aa  50.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  21.58 
 
 		 767 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  32.53 
 
 		 707 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  34.38 
 
 		 1628 aa  50.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  21.58 
 
 		 767 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  27.68 
 
 		 2552 aa  50.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  23.7 
 
 		 741 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  23.08 
 
 		 724 aa  49.3  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  22.3 
 
 		 1152 aa  49.3  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  31.28 
 
 		 685 aa  49.3  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  24.82 
 
 		 1096 aa  49.3  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  28.02 
 
 		 744 aa  48.9  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  35.82 
 
 		 5453 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  54.84 
 
 		 717 aa  48.9  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  28.83 
 
 		 830 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  24.44 
 
 		 433 aa  48.9  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  23.98 
 
 		 483 aa  48.1  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.84 
 
 		 626 aa  48.1  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3267  hypothetical protein  28.57 
 
 		 537 aa  47.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1058  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.34 
 
 		 536 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0674089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  29.44 
 
 		 505 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  25 
 
 		 1051 aa  46.6  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0531  collagen triple helix repeat  45.26 
 
 		 269 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.288675  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  25 
 
 		 1222 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10920  Mannuronan C-5-Epimerase  33.33 
 
 		 526 aa  47  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1238  alginate biosynthesis protein AlgG  30.6 
 
 		 536 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.61 
 
 		 230 aa  46.2  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  25.82 
 
 		 846 aa  45.8  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  24.3 
 
 		 614 aa  45.8  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  29.44 
 
 		 341 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.81 
 
 		 626 aa  45.8  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  23.73 
 
 		 838 aa  45.8  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.64 
 
 		 425 aa  45.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25 
 
 		 12684 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>