183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0970 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 1051 aa  2081    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  51.99 
 
 		 974 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.32 
 
 		 1049 aa  618  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  41.45 
 
 		 950 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.84 
 
 		 957 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  36.01 
 
 		 973 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  46.52 
 
 		 950 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 1119 aa  452  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 1077 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  39.89 
 
 		 1560 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  39.45 
 
 		 1281 aa  365  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  36.51 
 
 		 1092 aa  360  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 1182 aa  349  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 1282 aa  348  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 1132 aa  345  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  34.76 
 
 		 1060 aa  335  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 1007 aa  323  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  36.92 
 
 		 1004 aa  321  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  35.34 
 
 		 1164 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 1268 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  36.5 
 
 		 1148 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  34.62 
 
 		 1023 aa  309  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  46.26 
 
 		 996 aa  303  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.5 
 
 		 879 aa  300  7e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  34.54 
 
 		 905 aa  273  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  36.12 
 
 		 1047 aa  266  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  40.72 
 
 		 797 aa  258  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  31.64 
 
 		 821 aa  257  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  40.78 
 
 		 817 aa  256  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  36.08 
 
 		 769 aa  253  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  43.06 
 
 		 836 aa  251  7e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  33.57 
 
 		 876 aa  251  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  35.64 
 
 		 801 aa  250  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 860 aa  249  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  32.51 
 
 		 1026 aa  249  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  35.16 
 
 		 683 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  31.79 
 
 		 697 aa  248  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  42.64 
 
 		 807 aa  247  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  46.15 
 
 		 841 aa  244  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 851 aa  244  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 851 aa  244  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 851 aa  244  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  32.1 
 
 		 817 aa  241  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 		 1435 aa  238  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  43.28 
 
 		 1152 aa  238  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  44.27 
 
 		 854 aa  237  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  37.81 
 
 		 1402 aa  234  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  38.08 
 
 		 991 aa  234  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  43.53 
 
 		 818 aa  229  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 803 aa  228  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  35.51 
 
 		 965 aa  227  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  45.36 
 
 		 669 aa  226  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  42.54 
 
 		 637 aa  224  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  44.38 
 
 		 763 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  41.04 
 
 		 839 aa  222  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  43.09 
 
 		 843 aa  220  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  40.11 
 
 		 895 aa  219  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  41.97 
 
 		 829 aa  218  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  33.13 
 
 		 1000 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  39.25 
 
 		 863 aa  215  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  41.37 
 
 		 854 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  35.7 
 
 		 1310 aa  213  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 1034 aa  213  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  39.37 
 
 		 795 aa  211  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  42.43 
 
 		 769 aa  209  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  40.13 
 
 		 735 aa  208  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  43.33 
 
 		 733 aa  207  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  29.46 
 
 		 832 aa  202  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  29.46 
 
 		 764 aa  193  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  40.98 
 
 		 687 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  30.38 
 
 		 794 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  29.06 
 
 		 798 aa  185  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  30.64 
 
 		 839 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  46.19 
 
 		 670 aa  180  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  34.55 
 
 		 814 aa  178  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  35.56 
 
 		 805 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  35.53 
 
 		 799 aa  171  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  34.23 
 
 		 1076 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  38.36 
 
 		 832 aa  160  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  39.45 
 
 		 575 aa  151  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  39.74 
 
 		 769 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  37.83 
 
 		 436 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  32.79 
 
 		 516 aa  127  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  29.31 
 
 		 465 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  36.97 
 
 		 484 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  34.74 
 
 		 630 aa  114  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  28.98 
 
 		 600 aa  108  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  32.52 
 
 		 524 aa  104  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 412 aa  102  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 453 aa  97.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  34.97 
 
 		 539 aa  90.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  29.26 
 
 		 458 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  29.33 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  41.11 
 
 		 1022 aa  68.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  43.59 
 
 		 1031 aa  63.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  28.97 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.97 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0739  hypothetical protein  34.08 
 
 		 499 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.88 
 
 		 614 aa  56.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 		 613 aa  55.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>