135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2256 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  99.5 
 
 		 416 aa  803    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  100 
 
 		 400 aa  806    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  94.25 
 
 		 400 aa  758    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  99.5 
 
 		 416 aa  803    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  99.5 
 
 		 416 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  64.81 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  65.16 
 
 		 422 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  63.03 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  63.03 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  60.89 
 
 		 431 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  60.89 
 
 		 431 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  60.97 
 
 		 428 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  58.87 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  58.77 
 
 		 425 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  60.46 
 
 		 400 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  38.54 
 
 		 441 aa  285  7e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  39.32 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  39.95 
 
 		 437 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  37.15 
 
 		 483 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  37.91 
 
 		 457 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  35.12 
 
 		 467 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  38.13 
 
 		 428 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  36.98 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.13 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  39.95 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  38.5 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  35.25 
 
 		 439 aa  245  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  35.58 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  32.86 
 
 		 462 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.22 
 
 		 464 aa  240  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.22 
 
 		 464 aa  240  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  34.66 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  34.59 
 
 		 429 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  35.15 
 
 		 501 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  38.64 
 
 		 445 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  33.74 
 
 		 451 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  36.14 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  34.35 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  32.49 
 
 		 446 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  34.09 
 
 		 446 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  35.61 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  33.16 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  32.01 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  33.16 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.84 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  35.84 
 
 		 454 aa  209  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  32.64 
 
 		 429 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  31.51 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  31.17 
 
 		 431 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  34.02 
 
 		 503 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  30.12 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  31.28 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  33 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  31.33 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.78 
 
 		 459 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.42 
 
 		 458 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.98 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  33.51 
 
 		 459 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  29.56 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.18 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  25.93 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  29.21 
 
 		 452 aa  129  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  26.75 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  26.98 
 
 		 405 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  28.13 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.15 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  23.38 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  28.86 
 
 		 633 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  26.47 
 
 		 1200 aa  92.8  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  28.4 
 
 		 638 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  27.67 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  25.99 
 
 		 651 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.9 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  27.42 
 
 		 641 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  26.58 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  24.29 
 
 		 648 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  26.94 
 
 		 820 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  24.66 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  31.47 
 
 		 768 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.96 
 
 		 735 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  24.8 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  27.94 
 
 		 595 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  23.55 
 
 		 1025 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.23 
 
 		 677 aa  67.4  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  25.16 
 
 		 647 aa  67.4  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  27.84 
 
 		 672 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  26.85 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  29.44 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.07 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  25.14 
 
 		 892 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  22.86 
 
 		 570 aa  59.7  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  23.29 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.78 
 
 		 685 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  24.94 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  30.64 
 
 		 899 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  22.04 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  23.47 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  21.81 
 
 		 805 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  41.98 
 
 		 172 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  29.78 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>