84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0046 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  100 
 
 
685 aa  1359    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  25.41 
 
 
638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  27.2 
 
 
647 aa  112  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.04 
 
 
677 aa  98.6  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  25.17 
 
 
1200 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  28.29 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  27.92 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  23.74 
 
 
831 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  32.93 
 
 
1332 aa  67.4  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  28.97 
 
 
570 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  26.69 
 
 
382 aa  65.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  25.4 
 
 
422 aa  65.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  23.78 
 
 
1242 aa  65.1  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  25.6 
 
 
1931 aa  64.7  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  23.58 
 
 
501 aa  64.3  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  24.84 
 
 
417 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  25.44 
 
 
400 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  24.52 
 
 
423 aa  61.2  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  24.52 
 
 
423 aa  61.2  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  25.52 
 
 
431 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  27.86 
 
 
960 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  25.52 
 
 
431 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  25 
 
 
423 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  23.78 
 
 
400 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.78 
 
 
416 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.78 
 
 
416 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  27.45 
 
 
500 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  23.78 
 
 
416 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  26.5 
 
 
308 aa  57.4  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.53 
 
 
459 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.49 
 
 
458 aa  56.2  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  24.58 
 
 
452 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  24.84 
 
 
425 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  28.67 
 
 
409 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  24.73 
 
 
648 aa  56.2  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  23.77 
 
 
1025 aa  55.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.92 
 
 
467 aa  55.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  24.25 
 
 
641 aa  54.3  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  25.94 
 
 
410 aa  53.9  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  25.4 
 
 
352 aa  53.9  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  28.46 
 
 
442 aa  53.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  23.86 
 
 
400 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  23.55 
 
 
471 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  22.81 
 
 
462 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
1121 aa  53.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  31.61 
 
 
375 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.82 
 
 
467 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  29.19 
 
 
302 aa  52  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  24.58 
 
 
439 aa  52  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  25.16 
 
 
410 aa  52  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.75 
 
 
510 aa  52  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  25.09 
 
 
432 aa  51.6  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  27.3 
 
 
871 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  24.3 
 
 
505 aa  50.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.73 
 
 
458 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  24.05 
 
 
483 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  25.44 
 
 
459 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  31.28 
 
 
892 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  25 
 
 
454 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.38 
 
 
458 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  22.36 
 
 
429 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  27.92 
 
 
810 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  21.98 
 
 
454 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  25.85 
 
 
1628 aa  48.1  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  25.2 
 
 
711 aa  48.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  32.65 
 
 
735 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  25.37 
 
 
405 aa  47.8  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  27.86 
 
 
1001 aa  47.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  29.2 
 
 
707 aa  47.4  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  26.87 
 
 
972 aa  47.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  23.7 
 
 
445 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  24.75 
 
 
418 aa  46.2  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  20.15 
 
 
425 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  22.62 
 
 
439 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  24.66 
 
 
437 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  22.74 
 
 
429 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  22.66 
 
 
674 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.54 
 
 
594 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  27.73 
 
 
461 aa  45.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  24.23 
 
 
451 aa  44.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25 
 
 
425 aa  44.3  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.7 
 
 
614 aa  43.9  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  27.33 
 
 
462 aa  43.9  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  26.34 
 
 
5453 aa  43.9  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.119049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>