107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0246 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  81.78 
 
 
459 aa  663    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  100 
 
 
459 aa  904    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  80.4 
 
 
458 aa  667    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  79.52 
 
 
458 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  35.87 
 
 
501 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  37.13 
 
 
454 aa  226  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  34.56 
 
 
467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  36.68 
 
 
431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  36.68 
 
 
431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  32.49 
 
 
417 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  35.75 
 
 
423 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  35.82 
 
 
425 aa  203  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  32.85 
 
 
423 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  32.85 
 
 
423 aa  195  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  32.1 
 
 
432 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.04 
 
 
416 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.04 
 
 
416 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  33.78 
 
 
400 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  32.92 
 
 
437 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  34.04 
 
 
400 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  33.78 
 
 
416 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  33.95 
 
 
428 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  32.48 
 
 
400 aa  187  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  33.33 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  31.99 
 
 
454 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  30.42 
 
 
462 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  30.33 
 
 
464 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  30.33 
 
 
464 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  31.36 
 
 
439 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  31.65 
 
 
443 aa  170  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  30.17 
 
 
457 aa  170  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  30.53 
 
 
454 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  30.14 
 
 
462 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  31.4 
 
 
503 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  30.79 
 
 
451 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  31.34 
 
 
452 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  31.28 
 
 
445 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  30.65 
 
 
442 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  30.05 
 
 
439 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  27.76 
 
 
483 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.33 
 
 
428 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  31.07 
 
 
428 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  29.59 
 
 
422 aa  153  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  28.46 
 
 
418 aa  153  7e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  27.5 
 
 
452 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.88 
 
 
467 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  27.7 
 
 
404 aa  147  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  25.19 
 
 
441 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.84 
 
 
425 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  28.19 
 
 
410 aa  136  9e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  27.71 
 
 
410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  27.16 
 
 
429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.71 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.88 
 
 
424 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  26.72 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  25.87 
 
 
431 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  26.9 
 
 
424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  26.9 
 
 
429 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  23.33 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  24.81 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  25.63 
 
 
439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  25.25 
 
 
431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  21.37 
 
 
406 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  25.69 
 
 
428 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  24.43 
 
 
446 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.68 
 
 
447 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  26.59 
 
 
452 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  24.62 
 
 
633 aa  96.7  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  26.15 
 
 
638 aa  90.9  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  22.5 
 
 
1200 aa  87  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  25.4 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  25.71 
 
 
651 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  25.97 
 
 
711 aa  70.1  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.27 
 
 
510 aa  63.9  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  24.02 
 
 
672 aa  63.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  22.25 
 
 
471 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  23.55 
 
 
647 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  25 
 
 
871 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  22.22 
 
 
308 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  21.57 
 
 
570 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  30 
 
 
899 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  25.23 
 
 
648 aa  58.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0578  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.25 
 
 
364 aa  57.8  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.56022  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.16 
 
 
685 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  19.27 
 
 
892 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  22.27 
 
 
1025 aa  53.9  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  22.04 
 
 
341 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  21.26 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  21.96 
 
 
500 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  25 
 
 
1931 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  28.42 
 
 
1092 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  25.17 
 
 
804 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  20.98 
 
 
677 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  19.82 
 
 
820 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  21.23 
 
 
509 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  34.23 
 
 
2036 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  34.23 
 
 
1969 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  19.7 
 
 
409 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  25 
 
 
638 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  28.02 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>