107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2677 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  100 
 
 
651 aa  1303    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  44.81 
 
 
672 aa  532  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  44.93 
 
 
638 aa  486  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  42.86 
 
 
711 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  38.85 
 
 
633 aa  392  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  26.34 
 
 
428 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  26.04 
 
 
422 aa  94.7  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  24.34 
 
 
423 aa  94  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  25.41 
 
 
437 aa  94  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  24.34 
 
 
423 aa  94  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  24.32 
 
 
432 aa  92.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  24.43 
 
 
451 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  23.73 
 
 
431 aa  92  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  23.73 
 
 
431 aa  92  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  22.35 
 
 
501 aa  91.3  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  25.59 
 
 
416 aa  87.4  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  23.78 
 
 
442 aa  86.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  24.82 
 
 
443 aa  86.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.59 
 
 
416 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.59 
 
 
416 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  26.91 
 
 
445 aa  87  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  23.77 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  23.54 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  23.71 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  23.3 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  25.74 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  25.83 
 
 
400 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  22.49 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.77 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  22.89 
 
 
418 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  21.86 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.57 
 
 
425 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  23.19 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  24.52 
 
 
503 aa  76.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  22.17 
 
 
454 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.22 
 
 
459 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  23.76 
 
 
446 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  23.43 
 
 
446 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  21.89 
 
 
405 aa  72  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  22.58 
 
 
452 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  22.97 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  23.06 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.12 
 
 
464 aa  69.7  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.12 
 
 
464 aa  69.7  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  21.92 
 
 
452 aa  69.3  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  21.17 
 
 
462 aa  68.9  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  25.16 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  22.78 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  24.22 
 
 
406 aa  66.6  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  20.91 
 
 
404 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  21.62 
 
 
483 aa  65.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  25.68 
 
 
459 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  22.07 
 
 
1200 aa  63.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  21.93 
 
 
428 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  22.2 
 
 
410 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  22.58 
 
 
428 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.04 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  21.29 
 
 
439 aa  58.9  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.93 
 
 
447 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  33.71 
 
 
1092 aa  55.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  24.86 
 
 
409 aa  54.7  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  21.03 
 
 
417 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  23.92 
 
 
422 aa  53.9  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  36 
 
 
413 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  22.06 
 
 
570 aa  53.9  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  20.72 
 
 
457 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  36 
 
 
413 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  36 
 
 
413 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  36 
 
 
165 aa  51.2  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  47.17 
 
 
173 aa  50.8  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  25 
 
 
899 aa  50.8  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  20.51 
 
 
431 aa  50.4  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  27.38 
 
 
382 aa  50.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.93 
 
 
2036 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  28.93 
 
 
1969 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  23.08 
 
 
647 aa  49.7  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.17 
 
 
510 aa  49.3  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.22 
 
 
685 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0578  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.29 
 
 
364 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.56022  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  21.15 
 
 
431 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  20.32 
 
 
429 aa  47.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  25.2 
 
 
907 aa  47.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  20.42 
 
 
467 aa  47.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  20.71 
 
 
424 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  25.76 
 
 
205 aa  47  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  20.19 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  24.79 
 
 
911 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  24.79 
 
 
911 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  24.62 
 
 
882 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  21.73 
 
 
422 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  20.33 
 
 
428 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  32.05 
 
 
302 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  24.79 
 
 
911 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  35.14 
 
 
550 aa  45.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  24.79 
 
 
427 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  25.9 
 
 
2272 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  42.31 
 
 
975 aa  44.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  24.1 
 
 
883 aa  44.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>