91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1567 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 452 aa  931    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  47.81 
 
 		 422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  44.36 
 
 		 405 aa  342  7e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  43.56 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  43.73 
 
 		 410 aa  309  5.9999999999999995e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  43.37 
 
 		 418 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  34.29 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  34.11 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  30.73 
 
 		 431 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  30.73 
 
 		 431 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  29.29 
 
 		 501 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  29.82 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  30.26 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  29.9 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  30.81 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  29.97 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  30.98 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  28.98 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  28.68 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.12 
 
 		 459 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  28.44 
 
 		 462 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.7 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  27.93 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  30.07 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.79 
 
 		 458 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  29.56 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  30.47 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  27.83 
 
 		 462 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  30.47 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  26.54 
 
 		 459 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  29.19 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.83 
 
 		 467 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  29.21 
 
 		 416 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  29.21 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  29.21 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  29.21 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  28.5 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  27.83 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  26.64 
 
 		 452 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.13 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  26.51 
 
 		 454 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.21 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  30.57 
 
 		 445 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.93 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.93 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  26.09 
 
 		 503 aa  114  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  27.82 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  25.79 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.03 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  27.03 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  24.3 
 
 		 483 aa  103  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  25.71 
 
 		 439 aa  103  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  27.18 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  25.49 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.37 
 
 		 447 aa  94.4  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.69 
 
 		 424 aa  94.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.53 
 
 		 467 aa  94  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  24.3 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  26.23 
 
 		 439 aa  93.6  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  26.05 
 
 		 431 aa  93.2  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  25.9 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  25.39 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  23.97 
 
 		 633 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  24.81 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  25.92 
 
 		 446 aa  90.1  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  26.25 
 
 		 446 aa  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  28.69 
 
 		 1200 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  24.19 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0578  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.05 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.56022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  26.43 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  25.73 
 
 		 422 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  21.35 
 
 		 651 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.71 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  21.43 
 
 		 638 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  24.88 
 
 		 707 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  22.22 
 
 		 711 aa  53.9  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  24.11 
 
 		 648 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  24.79 
 
 		 647 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  32.77 
 
 		 365 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  29.27 
 
 		 1092 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  25.84 
 
 		 2272 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  25.34 
 
 		 810 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  20.76 
 
 		 352 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  29.46 
 
 		 172 aa  46.6  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  42 
 
 		 975 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  26.38 
 
 		 899 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  31.25 
 
 		 302 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  25.6 
 
 		 552 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  23.2 
 
 		 1628 aa  44.7  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.01 
 
 		 677 aa  44.3  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  45.24 
 
 		 2036 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>