46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1533 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  78.34 
 
 		 883 aa  1418    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  77.3 
 
 		 882 aa  1376    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  100 
 
 		 911 aa  1885    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  91.99 
 
 		 907 aa  1660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  74.52 
 
 		 880 aa  1354    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  76.5 
 
 		 884 aa  1414    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  98.79 
 
 		 911 aa  1868    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  99.12 
 
 		 911 aa  1869    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  48.73 
 
 		 395 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  44.42 
 
 		 393 aa  328  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  48.17 
 
 		 394 aa  327  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  47.61 
 
 		 394 aa  324  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  47.32 
 
 		 394 aa  321  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  46.2 
 
 		 390 aa  319  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  44.59 
 
 		 411 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  43.47 
 
 		 396 aa  292  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  42.35 
 
 		 366 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  41.76 
 
 		 367 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  40.95 
 
 		 367 aa  268  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  44.01 
 
 		 374 aa  265  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  41.38 
 
 		 368 aa  258  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  42.48 
 
 		 345 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  40.23 
 
 		 402 aa  231  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  37.74 
 
 		 343 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  36.81 
 
 		 413 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  36.81 
 
 		 413 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.65 
 
 		 413 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  37.83 
 
 		 415 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.69 
 
 		 411 aa  215  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  39.14 
 
 		 400 aa  207  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  35.63 
 
 		 383 aa  204  8e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1644  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.64 
 
 		 423 aa  170  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.202542  normal  0.498245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  35.05 
 
 		 768 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  27.65 
 
 		 386 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  27.61 
 
 		 509 aa  101  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  29.05 
 
 		 359 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  23.81 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  23.81 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  23.81 
 
 		 366 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  25.98 
 
 		 2172 aa  78.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  26.37 
 
 		 427 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  23.29 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  30 
 
 		 981 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.75 
 
 		 425 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5589  hypothetical protein  28.47 
 
 		 491 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  31.43 
 
 		 550 aa  44.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>